Xcalibur查看文件操作

打开某DIA raw文件

1.查看XIC

固定图钉

 右键，ranges

Auto Processing设置如下

输入肽段的质荷比

407.8410

 2 查看肽段的子离子

首先要知道肽段的序列和BY离子的单同位素质量

https://prospector.ucsf.edu/prospector/cgi-bin/msform.cgi?form=msdigest

Digest选择 Full Protein，下面的UserProteinSequence输入“RVIGHSMQNCL”

点击“perform Digest”，在页面继续点击序列链接，得到

Figure 1

 

这个肽段是一个2+离子，m/z是629.3152

分2步，

先看到XIC，确定RT，这个和上面一样

 

然后把图钉固定到质谱图，然后再色谱图上截取一段

设置质谱显示肽段范围是（630~640）的二级质谱

 

 确认下选择

 

 

现在我们要找Y2，1+子离子

先找到Y2 单同位素质量是235.1111

可以直接找到

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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