随笔分类 -  GS

摘要:1. 理论 rrBLUP是基因组选择最常用的模型之一,也是间接法模型的代表。回顾一下,所谓间接法是指:在参考群中估计标记效应,再结合预测群的基因型信息将标记效应累加,最终获得预测群的个体估计育种值。而直接法则是指:将个体作为随机效应,参考群体和预测群体遗传信息构建的亲缘关系矩阵作为方差协方差矩阵,通 阅读全文
posted @ 2020-12-09 17:01 生物信息与育种 阅读(8096) 评论(2) 推荐(1)
摘要:文献来源: 尹立林, 马云龙, 项韬, 朱猛进, 余梅, 李新云, 刘小磊, 赵书红. 全基因组选择模型研究进展及展望[J]. 畜牧兽医学报, 2019, 50(2): 233-242. 华中农大赵书红老师于2019年发表在《 畜牧兽医学报》上的综述,主要针对动物。 1. GS概况 2009年开始奶 阅读全文
posted @ 2020-11-26 23:36 生物信息与育种 阅读(2829) 评论(1) 推荐(1)
摘要:Genomic SelectioninPlant Breeding: Methods,Models,and Perspectives 国际玉米小麦改良中心(CIMMYT)José Crossa 2017年发表在《Trends in Plant Science》上的综述。 1. GS/GP在植物育种中 阅读全文
posted @ 2020-11-26 20:50 生物信息与育种 阅读(1570) 评论(0) 推荐(0)
摘要:GS应用主要在国外大型动物和种企,国内仍以学术为主。近期整理相关学术文献,了解到一些相关研究人员,记录下备忘查询,但不可能全面。 1.GS研究 Theo Meuwissen(挪威生命科学大学) GS概念提出者,号称“基因组选择之父”,贝叶斯方法为主,但是做动物的,所以可略过。 https://www 阅读全文
posted @ 2020-11-19 13:37 生物信息与育种 阅读(739) 评论(0) 推荐(1)
摘要:综述:Genomic Selection in the Era of Next Generation Sequencing for Complex Traits in Plant Breeding 要点: MAS仅对数量较少的主效QTL有效,而GS适用于大量微效QTL控制的复杂数量性状。GS根据分布 阅读全文
posted @ 2020-11-13 16:45 生物信息与育种 阅读(686) 评论(0) 推荐(0)
摘要:全基因组选择(Genomic selection, GS)是一种利用覆盖全基因组的高密度标记进行选择育种的新方法,可通过早期选择缩短世代间隔,提高育种值(Genomic Estimated Breeding Value, GEBV)估计准确性等加快遗传进展,尤其对低遗传力、难测定的复杂性状具有较好的 阅读全文
posted @ 2020-05-13 15:46 生物信息与育种 阅读(26678) 评论(0) 推荐(1)