摘要：速来围观！——三种NCBI常见数据库 在微生物测序分析中，常常需要对未知的核酸或蛋白序列进行物种,功能或类别注释。注释方法种类较多，其中最常用的是与一些标准数据库进行相似性搜索，也就是序列比对。因此，数据库的优劣对注释结果至关重要。本期小编为大家带来的是NCBI上的三个重要的数据库—NR/NT，Ta 阅读全文

摘要：微生物群落多样性测序与功能分析 1.几个概念：16S rDNA（或16S rRNA）；OTU；测序区段。 1.3测序区段：由于16S rDNA较长（1.5kb），我们只能对其中经常变化的区域也就是可变区进行测序。16S rDNA包含有9个可变区，分别是v1-v9。一般我们对v3-v4双可变区域进行扩 阅读全文

摘要：分子伴侣（Chaperone），又称为侣伴蛋白（molecular chaperone）。英文单词原意是指姆，即负责监管、教育年轻未婚少女的行为的老年妇女。是一类协助细胞内分子组装和协助蛋白质折叠的蛋白质。包括热休克蛋白Hsp60和Hsp70两个家族。另外，使用ATP协助蛋白质折叠只是一部分分子伴侣 阅读全文

摘要：转运-信使RNA（Transfer-messenger RNA），是一种细菌的RNA分子，是tRNA和信使RNA类似物。 tmRNA的用途十分广泛，它可用于回收停滞的核糖体，并有利于异常的信使RNA的降解。 阅读全文

摘要：神秘的细菌基因组：GC skew 科学就是整理事实，以便从中得出普遍的规律和结论。from 达尔文 原文链接：神秘的细菌基因组：GC skew 每当我们拼接出一个完整的细菌基因组时，总是迫不及待地画出它的图谱，一个常见的细菌基因组图谱如下所示： 最外圈为正负链上的编码区及结构RNA基因，其内为基因组 阅读全文

摘要： 阅读全文

摘要：ORF是什么？ 开放阅读框（英语：Open reading frame；缩写：ORF；其他译名：开放阅读框架、开放式阅读框架，开放读架等）是生物个体的基因组中，可能是蛋白质编码序列的部分。基因中的ORF包含并位于开始编码与终止编码之间。由于一段DNA或RNA序列有多种不同读取方式，因此可能同时存在许 阅读全文