随笔分类 -  Programming skills

摘要:GBIF的全称是Global Biodiversity Information Facility,全球最大的生物多样性数据共享平台。由于网络原因,使用R语言调用API批量下载或处理数据记录时,可能会由于延迟而报错。因此有时候,也有必要在网页上“所见即所得”地手动下载数据,等待邮件的数据下载通知。例如 阅读全文
posted @ 2024-04-08 22:05 LeleLiu 阅读(3485) 评论(0) 推荐(1)
摘要:Leaflet 是一个开源并且对移动端友好的交互式地图 JavaScript 库。 在R语言中也使用相应的leaflet包调用。 然而,在国内,一些国外的地图资源在加载或使用中会存在问题。 为此,需要一个适应国情的扩展包leafletCN (GitHub - Lchiffon/leafletCN: 阅读全文
posted @ 2023-11-16 16:48 LeleLiu 阅读(499) 评论(0) 推荐(0)
摘要:甘特图(Gantt chart)是用来规划和展示项目进度的一种图表形式,在一些项目汇报时会经常用到。这里介绍在R里使用plotrix包绘制甘特图的代码。首先安装和加载所需要的软件包。 # install.packages("plotrix") library(plotrix) 然后构建一个数据集,注 阅读全文
posted @ 2022-09-11 16:19 LeleLiu 阅读(1149) 评论(0) 推荐(0)
摘要:现有的zotero插件中,找到可以支持更新影响因子青柠学术的Zotero IF,但它的代码没有公开,需要关注微信公众号才能获取免费版,免费版的影响因子更新也不是很及时;它的Pro版本功能更多,但需要收费,建议有需求的小伙伴去下载,创作不易,支持好用的原创工具。 Zotero本身为开发者提供了Java 阅读全文
posted @ 2022-06-29 19:29 LeleLiu 阅读(3868) 评论(0) 推荐(0)
摘要:海量的高通量测序数据为微卫星(SSR)标记开发提供了便利条件,MISA等一大批SSR引物开发软件被开发出来,但这些软件要么不能筛选有多态性的位点,要么仅限于linux平台,要么依赖的其他软件比较多,总而言之,是对菜鸟新手不友好。 幸运的是,我找到了四川农业大学刘亚西教授等去年发布的SSRMMD软件, 阅读全文
posted @ 2021-08-15 15:14 LeleLiu 阅读(852) 评论(0) 推荐(0)
摘要:国家自然基金委网站提供基金项目资助的项目检索功能,但需要提交字段较多,且有验证码,不太适合网页抓取。 Medsci和LetPub两个科研服务网站提供了免费的查询功能,也有更高级收费分析服务,无钱只能白嫖的我更倾心LetPub,LetPub可选择多个字段,也无需登陆,get方式传递参数。(2020年7 阅读全文
posted @ 2019-12-06 14:14 LeleLiu 阅读(486) 评论(0) 推荐(0)
摘要:v1.0 阅读全文
posted @ 2019-09-14 10:15 LeleLiu 阅读(1412) 评论(0) 推荐(0)
摘要:使用perl自带函数rename可以重命名文件名称,具体用法,rename $old_name, $new_name。 例如,要把文件名中“7--1_F03_2018-12-28.fsa”中的前缀“7--”去除。 再如调换A01_1.fsa名字中的下划线前后的顺序,简化版为: 关于perl的文件系统 阅读全文
posted @ 2019-03-28 19:15 LeleLiu 阅读(1682) 评论(0) 推荐(1)
摘要:分别利用颜色(colour)和形状(shape i.e. pch)进行分组很多属性需要单独设置。 用到的对象有 数据映射(Aes,Data aesthetic mappings) 几何属性(Geom,Geometric objects) 统计转换(Stat,Statistical transform 阅读全文
posted @ 2019-02-03 12:13 LeleLiu 阅读(6369) 评论(0) 推荐(0)
摘要:PAM 2500导出的数据是以分号为分隔符的纯文本,且一次测量单独保存在文件里,默认以日期加括号里的序号为文件名,我们只需要其中的Fo、Fm和最后一次的数据。 原始数据如下: 我们需要以提取第3行和第15行的数据整合成一个新的文件,我们把所有需要整合的文件放在同一文件夹下,运行脚本如下: 手动加入表 阅读全文
posted @ 2018-12-30 19:48 LeleLiu 阅读(842) 评论(0) 推荐(0)
摘要:使用perl 输入文件格式 阅读全文
posted @ 2018-09-11 12:46 LeleLiu 阅读(218) 评论(0) 推荐(0)
摘要:习题: 对某地区的某消费品的销售量Y进行调查,它与下面四个变量有关:x1居民可支配收入,x2该类消费品平均价格指数,x3社会该消费品保有量,x4其他消费品平均价格指数,历史资料如下表所示。试用主成分回归方法建立销售量Y与其他四个变量x1,x2, x3 和 x4的回归方程。 数据资料data.txt: 阅读全文
posted @ 2018-05-24 15:49 LeleLiu 阅读(4580) 评论(3) 推荐(1)
摘要:习题: 9.1用主成分方法探讨城市工业主体结构。下表是某事工业部门十三个行业,分别是冶金(1)、电力(2)、煤炭(3)、化学(4)、机械(5)、建材(6)、森工(7)、食品(8)、纺织(9)、缝纫(10),皮革(11)、造纸(12)和文教艺术用品(13),八个指标分别是年末固定资产净值X1(万元)、 阅读全文
posted @ 2018-05-22 21:13 LeleLiu 阅读(3673) 评论(2) 推荐(0)
摘要:题目: 对48名应聘者数据的自变量作聚类分析,选择变量的相关系数作为变量间的相似系数(cij),距离定义为dij=1-cij。分别用最长距离法、均值法、重心法和Ward法作聚类分析,并画出相应的谱系图。如果将所有变量分为5类,试写出各种方法的分类结果。 数据(applicant.data): 脚本: 阅读全文
posted @ 2018-05-17 23:55 LeleLiu 阅读(2062) 评论(0) 推荐(0)
摘要:题目: 为了深入地了解我国人口的文化程度,利用1990年全国普查数据对全国30个省、直辖市、自治区进行聚类分析,分别选用了三个指标:(1)大学以上文化程度的人口占全部人口的比例(DXBZ);(2)初中文化程度的人口占全部人口的比例(CZBZ);(3)文盲半文盲人口占全部人口的比例(WMBZ)分别用来 阅读全文
posted @ 2018-05-17 23:29 LeleLiu 阅读(7484) 评论(0) 推荐(0)
摘要:8.2 某医院研究心电图指标对健康人(1),硬化病患者(2)和冠心病患者(3)的鉴别能力,先训练样本如下。试用距离判别(考虑方差相同与方差不同两种情况)、Bayes判别(考虑方差同和不同两种情况,且先验概率为11/23,7/23,5/23)对数据进行分析。 原始数据 data.txt如下, 3,4, 阅读全文
posted @ 2018-05-14 18:10 LeleLiu 阅读(1036) 评论(0) 推荐(0)
摘要:习题:根据经验,今天和昨天的湿度差X1及今天的压温差X2是预报天气下雨和不下雨的两个重要因素。现有数据如下,今测得x1=8.1,x2=2.0,试问预报明天下雨还是预报明天不下雨?分别用距离判别、Bayes判别(考虑方差相同和方差不同两种情况)和Fisher判别来得到你所需要的结论。 数据: 雨天 非 阅读全文
posted @ 2018-05-14 15:50 LeleLiu 阅读(5507) 评论(0) 推荐(0)
摘要:作业一 计算器程序,编写一个可以进行加减乘除运算的程序。 解法1. 解法2. 作业二.编写一个程序,可以输出倒三角形,直角三角形,正三角形,菱形,反平行四边形,平行四边形六种图形。 解法: 作业三.(1)编写一个程序,往一个从小到大排列的数组中插入任意的数字,要求插入数字后数组还是要从小到大排列。 阅读全文
posted @ 2017-06-20 05:28 LeleLiu 阅读(447) 评论(0) 推荐(0)
摘要:1、视频 由于某些原因,自己的服务器没有足够打的空间上传视频,或者宽带不够,或者视频太多又没有后台方便管理,可使用第三方服务。 推荐优酷,提供了flash/html/iframe等几种方式 推荐优酷,提供了flash/html/iframe等几种方式 推荐优酷,提供了flash/html/ifram 阅读全文
posted @ 2017-06-20 05:14 LeleLiu 阅读(485) 评论(0) 推荐(0)
摘要:javascript作为编程语言,虽然灵活,但内置函数过少、不同浏览器存在兼容系问题,所以自己学习写一个简易的底层库对理解这门语言是非常重要的。下面的代码是根据某教程改写的。现重新备份如下 阅读全文
posted @ 2017-06-20 04:43 LeleLiu 阅读(366) 评论(0) 推荐(0)