小鲨鱼2018

摘要： centos中安装那个cmake。 1、问题 [root@PC3 home]# cmake bash: cmake: command not found... Similar command is: 'make' 当前系统： [root@PC3 home]# lsb_release -a LSB V 阅读全文

摘要： 杂合度计算分为两种：位点杂合度和样本杂合度 1、计算位点杂合度，测试数据如下: [root@centos79 test]# ls outcome.map outcome.ped [root@centos79 test]# cat outcome.map ## 8个snp位点 1 snp1 0 559 阅读全文

摘要： 1、 [root@centos79 test]# cat a.txt 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 [root@centos79 test]# sed '/2/ s/^/xxx/' a.txt 1 xxx2 3 4 5 6 7 8 9 10 [root@centos79 test]# s 阅读全文

摘要： 1、测试数据如下： [root@centos79 test]# seq 10 > a.txt [root@centos79 test]# ls a.txt [root@centos79 test]# cat a.txt 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 2、提取第2行 [root@cento 阅读全文

摘要： plink --filp命令实现正负链的反转 1、 [root@centos79 test]# ls ## 测试数据如下， 8个位点， 8个样本 a.txt outcome.map outcome.ped [root@centos79 test]# cat outcome.map 1 snp1 0 阅读全文

摘要： 1、 dat <- read.table("test.map",header = F) dat2 <- dat[c(1,4)] unique(sort(dat2$V1)) dat2[dat2$V1 == "X",]$V1 = 10000 dat2$V1 <- as.numeric(dat2$V1) 阅读全文

摘要： 1、 a <- c(1,3,10,6,2) class(a) order(a) ## 数值型， 排序结果 10 > 2 b <- c(1,3,10,6,2,"x") class(b) order(b) ##字符型，排序结果 10 < 2 阅读全文

摘要： linux系统中find命令 1、直接查找文件名 测试文件如下： [root@centos79 test]# ls 01.txt 02.csv 02.txt 03.csv 04.txt [root@centos79 test]# find "02.txt" 02.txt [root@centos79 阅读全文

摘要： 1、查看环境变量 [root@centos79 tmp]# export | wc -l 29 [root@centos79 tmp]# export declare -x HISTCONTROL="ignoredups" declare -x HISTSIZE="1000" declare -x 阅读全文

摘要： 1、rename命令 [root@centos79 test]# ls a.mp4 dup1.mp4 dup2.mp4 dup4.mp4 [root@centos79 test]# rename mp4 txt *.mp4 [root@centos79 test]# ls a.txt dup1.tx 阅读全文