小鲨鱼2018

2022年4月27日

Err:1 http://archive.ubuntu.com/ubuntu focal InRelease

摘要： 1、问题，执行apt-get update时出现如下报错： Err:1 http://archive.ubuntu.com/ubuntu focal InRelease 2、阅读全文

posted @ 2022-04-27 12:15 小鲨鱼2018 阅读(2200) 评论(0) 推荐(0)

摘要： 1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# ls Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# samtools faidx Arabido 阅读全文

posted @ 2022-04-27 09:54 小鲨鱼2018 阅读(916) 评论(0) 推荐(0)

利用picard对参考基因组构建dict文件

摘要： 1、方式1 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# ls Arabidopsis_thaliana.TAIR10.dna.toplevel.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test/test2# java -jar /home/sof 阅读全文

posted @ 2022-04-27 09:51 小鲨鱼2018 阅读(1848) 评论(0) 推荐(0)

QStandardPaths: XDG_RUNTIME_DIR not set, defaulting to '/tmp/runtime-root'

摘要： 1、问题 2、解决方法 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# vim /etc/profile ## 在配置文件末尾追加如下两句 export XDG_RUNTIME_DIR=/usr/lib/ export RUNLEVEL=3 source一下： root@DESK 阅读全文

posted @ 2022-04-27 00:37 小鲨鱼2018 阅读(6236) 评论(0) 推荐(0)

2022年4月26日

linux 中调用shell脚本时指定工作目录为shell脚本所在的目录

摘要： 1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls /home/test2/* /home/test2/a.txt /home/test2/test.sh root@DESKTOP-1N42TVH:/h 阅读全文

posted @ 2022-04-26 23:21 小鲨鱼2018 阅读(3179) 评论(0) 推荐(0)

修改 WSL2 可用内存大小和交换分区大小

摘要：来源： https://blog.csdn.net/weixin_45579994/article/details/112386425 WSL2默认可以使用的内存大小为主机的80%,对于Linux而言即使装了桌面,一般的开发也没必要给这么多内存,分多了,反而有可能卡主机的Windows操作:1.打开阅读全文

posted @ 2022-04-26 22:03 小鲨鱼2018 阅读(3897) 评论(0) 推荐(0)

linux 中 awk命令统计A、C、T、G碱基数目

摘要： 001、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls outcome.ped root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat outcome.ped G G C C G G T T G G C C G G T G G G C C A A T 阅读全文

posted @ 2022-04-26 21:16 小鲨鱼2018 阅读(270) 评论(0) 推荐(0)

linux 中shell脚本统计参考基因组中碱基的总数目

摘要： 1、方法1 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls hg38.fa root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# grep -v "^>" hg38.fa | awk 'BEGIN{sum = 0} {sum += length($0)} END 阅读全文

posted @ 2022-04-26 17:10 小鲨鱼2018 阅读(328) 评论(0) 推荐(0)

linux中如何将一行数据转换为一列数据

摘要： 1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat test.txt i j k s root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# sed -n l 阅读全文

posted @ 2022-04-26 15:21 小鲨鱼2018 阅读(1123) 评论(0) 推荐(0)

linux中如何给数据添加行号

摘要： 1、测试数据 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat test.txt i j k x c b z c b e g a 2、输出行序号 root@DESKTOP-1N42T 阅读全文

posted @ 2022-04-26 15:10 小鲨鱼2018 阅读(427) 评论(0) 推荐(0)

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