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1、 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# ls test.r root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# cat test.r ## 测试函数 argv <- commandArgs(TRUE) ## 参数收集在argv数组中 print(pa 阅读全文
posted @ 2022-04-28 22:38
小鲨鱼2018
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摘要：
ubuntu安装R遇到如下问题： root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# apt install r-base-core 1、系统内核 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test2# lsb_release -a No LSB modules are 阅读全文
posted @ 2022-04-28 22:01
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1、自定义函数之位置参数 > testfun1 <- function(arg1, arg2){ ## 自定义函数，给与两个参数arg1、arg2 + result = arg1 - arg2 + print(result) + } > testfun1(10, 3) ## 默认就是位置参数，即ar 阅读全文
posted @ 2022-04-28 20:25
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001、 > a <- c("abc", "bcd", "ead") > b <- c("ead", "aya", "dbe") > c <- c("mna", "ond", "dne") > d <- data.frame(a, b, c) > d a b c 1 abc ead mna 2 bc 阅读全文
posted @ 2022-04-28 19:55
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1、 > sub("b", "x", c("abbc", "bbcd", "cde")) ## 三个字符串中第一个“b”被替换为了“x” [1] "axbc" "xbcd" "cde" > gsub("b", "x", c("abbc", "bbcd", "cde")) ##gsub中的g表示全局， 阅读全文
posted @ 2022-04-28 19:41
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1、数据框或矩阵中字符串的批量替换 > a <- c("a","d", "v", "c") > b <- c("c", "b", "a", "d") > c <- c("m", "a", "d", "b") > d <- data.frame(a, b, c) > d a b c 1 a c m 2 阅读全文
posted @ 2022-04-28 18:58
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1、当参考基因组 大于2G时（约20亿个核苷酸，20,0000,0000）：bwa index -a bwtsw xxx.fa 小于2G时（约20亿个核苷酸，20,0000,0000）：bwa index xxx.fa 2、统计参考基因组碱基数目 root@DESKTOP-1N42TVH:/home 阅读全文
posted @ 2022-04-28 00:05
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