小鲨鱼2018

2022年8月24日

摘要： 001、矩阵乘法符号 %*%；矩阵相乘的条件是：左侧矩阵的列数等于右侧矩阵的行数；相乘的结果是矩阵的行数灯油左侧矩阵的行数，列数等于右侧矩阵的列数。 c1 = c(2,3) c2 = c(1,5) c3 = c(4,2) dat1 <- (data.frame(c1, c2, c3)) da 阅读全文

posted @ 2022-08-24 16:05 小鲨鱼2018 阅读(5214) 评论(0) 推荐(0)

R语言中累积求和和累积求积

摘要： 001、 a <- c(2, 3, 6) a cumsum(a) ## 累积求和 cumprod(a) ## 累积求积阅读全文

posted @ 2022-08-24 15:53 小鲨鱼2018 阅读(197) 评论(0) 推荐(0)

R语言中求积和

摘要： 001、 a <- c(2, 3, 6) b <- c(3, 1, 4) temp = 0 ## 利用循环实现 for (i in 1:length(a)) { temp = temp + a[i] * b[i] } temp 2、内置函数实现 a <- c(2, 3, 6) b <- c(3, 1 阅读全文

posted @ 2022-08-24 15:49 小鲨鱼2018 阅读(115) 评论(0) 推荐(0)

Seurat4.0单细胞数据分析细胞pca值的计算验证

摘要： 001、前期处理： https://www.jianshu.com/p/4f7aeae81ef1 基本过程如上图： 001、左图数据为scale.data, pbmc[["RNA"]]@scale.data 002、中图数据为feature.loadings, pbmc[["pca"]]@featu 阅读全文

posted @ 2022-08-24 15:29 小鲨鱼2018 阅读(242) 评论(0) 推荐(0)

R语言实现创建空数据框的时候指定行数

摘要： 001、 dat <- data.frame(matrix(, nrow = 5, ncol = 0)) ## 创建空数据框，指定行数为5 dat a = 1:5 cbind(dat, a) ## 可以实现直接合并新的列阅读全文

posted @ 2022-08-24 14:46 小鲨鱼2018 阅读(500) 评论(0) 推荐(0)

Seurat4.0单细胞数据分析数据的归一化

摘要： 001、数据的归一化是在数据的标准化的基础上进行的，而且是按照行来进行的，即： (每一行的观测值 - 每一行的平均值)/每一行的标准差验证： a、前期步骤参考：https://www.jianshu.com/p/4f7aeae81ef1 b、 all.genes <- rownames(pbmc 阅读全文

posted @ 2022-08-24 12:33 小鲨鱼2018 阅读(254) 评论(0) 推荐(0)

2022年8月23日

R语言中如何查看是否安装了Rtools

摘要： 001、一下查询结果显示没有安装。 pkgbuild::find_rtools(debug = TRUE) 002、安装rtools（以版本对应）下载rtools：https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/ 003、双击下载好的安装包进行安装，阅读全文

posted @ 2022-08-23 22:57 小鲨鱼2018 阅读(4642) 评论(0) 推荐(0)

不存在叫‘pbmc3k.SeuratData’这个名字的程辑包

摘要： 001、问题 002、解决方法 BiocManager::install("pbmc3k.SeuratData") 阅读全文

posted @ 2022-08-23 22:41 小鲨鱼2018 阅读(793) 评论(0) 推荐(0)

python中输出列表中的重复项

摘要： 001、 >>> list1 = ["aa", "bb", "aa", "cc", "aa", "aa", "cc","ee"] ## 测试列表 >>> list1 ['aa', 'bb', 'aa', 'cc', 'aa', 'aa', 'cc', 'ee'] >&g 阅读全文

posted @ 2022-08-23 20:34 小鲨鱼2018 阅读(139) 评论(0) 推荐(0)

linux 中实现根据特定列的重复项提取数据

摘要： 001、 (base) root@PC1:/home/test3# ls a.txt (base) root@PC1:/home/test3# cat a.txt ## 测试数据 1 aa 2 bb 3 aa 4 cc 5 dd 6 cc 7 kk 8 aa 9 kk ## 根据第二列的重复项筛选数阅读全文

posted @ 2022-08-23 20:16 小鲨鱼2018 阅读(278) 评论(0) 推荐(0)

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