小鲨鱼2018

2023年1月12日

linux 中非root用户安装R：configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https

摘要： 001、问题： configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers are required with support for https 002、解决方法：切回root，安装curl [root@PC1 software]# wget 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:22 小鲨鱼2018 阅读(1574) 评论(0) 推荐(0)

linux 中下载和安装curl

摘要： 001、下载curl：官网 [root@PC1 software]# wget https://curl.se/download/curl-7.61.0.tar.gz --no-check-certificate [root@PC1 software]# ls curl-7.61.0.tar.gz 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:17 小鲨鱼2018 阅读(1567) 评论(0) 推荐(0)

linux 中普通用户安装R：configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available

摘要： 001、问题：configure: error: --with-x=yes (default) and X11 headers/libs are not available 002、解决方法 a、切换为root用户 [liujiaxin01@PC1 R-4.2.1]$ su - root Passw 阅读全文

posted @ 2023-01-12 22:05 小鲨鱼2018 阅读(2063) 评论(0) 推荐(0)

linux中普通用户安装R：configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not availabl

摘要： 001、问题 configure: error: --with-readline=yes (default) and headers/libs are not available 002、解决方法 a、切换回root用户 [liujiaxin01@PC1 R-4.2.1]$ su - root Pa 阅读全文

posted @ 2023-01-12 21:55 小鲨鱼2018 阅读(1713) 评论(0) 推荐(0)

linux 中将科学计数法表示的数值转换成普通数值、普通数值转换为科学计数法表示

摘要： 001、 [root@pc1 test2]# ls a.txt [root@pc1 test2]# cat a.txt ## 测试数据 snp2037 475 65 -7.77868e-06 snp5835 646 65 -7.77868e-06 snp5837 650 65 -7.77868e-0 阅读全文

posted @ 2023-01-12 11:40 小鲨鱼2018 阅读(363) 评论(0) 推荐(0)

2023年1月10日

linux 中shell脚本实现将fasta文件中每一条scaffold中的碱基转换为一行

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.fa [root@PC1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 AACCCTTG TTCCCCC >chr2 CCCTTTTT CCCCCCCC TTTT >chr3 TTTTCCCC GGGG [root@PC1 阅读全文

posted @ 2023-01-10 22:36 小鲨鱼2018 阅读(81) 评论(0) 推荐(0)

Linux 中shell脚本输出fasta文件中每一条scaffold碱基的总长度

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls a.fa [root@PC1 test]# cat a.fa ## 测试fasta文件 >chr1 AACCCTTG TTCCCCC >chr2 CCCTTTTT CCCCCCCC TTTT >chr3 TTTTCCCC GGGG [root@PC1 阅读全文

posted @ 2023-01-10 22:22 小鲨鱼2018 阅读(83) 评论(0) 推荐(0)

2023年1月9日

Linux 中bc命令实现自然对数、指数运算、自然指数、平方根的运算

摘要： 001、bc实现自然对数运算 [root@pc1 ~]# echo "l(10)" | bc -l ## 实现自然对数运算 2.30258509299404568401 [root@pc1 ~]# echo "l(2.7328)" | bc -l ## 实现自然对数运算 1.005326724612 阅读全文

posted @ 2023-01-09 10:31 小鲨鱼2018 阅读(845) 评论(0) 推荐(0)

2023年1月7日

python 脚本同时统计文件的行数和列数

摘要： 001、 [root@PC1 test]# ls outcome.map test.py [root@PC1 test]# cat outcome.map ## 测试数据 55910 85204 jj 122948 yy kk 203750 rr ee ss 312707 dd ff 356863 阅读全文

posted @ 2023-01-07 23:47 小鲨鱼2018 阅读(88) 评论(0) 推荐(0)

linux 中sed命令输出匹配项并进行替换

摘要： 001、 [b20223040323@admin1 test]$ ls a.txt [b20223040323@admin1 test]$ cat a.txt 33 jj aa dd aa ff 88 rf ee aa ff 33 [b20223040323@admin1 test]$ sed -n 阅读全文

posted @ 2023-01-07 22:38 小鲨鱼2018 阅读(178) 评论(0) 推荐(0)

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