摘要：
001、minimap2比对，生成paf格式数据 minimap2 -t 16 -x asm5 GCA_024222175.11_27.fna GCF_016772045.2_ARS-UI_Ramb1_27.fna > Romanov_vs_Ramb.paf 002、 下载可视化工具：dotPlot 阅读全文
posted @ 2025-11-26 23:46
小鲨鱼2018
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摘要：
001、 [root@PC1 test]# ls a.txt [root@PC1 test]# cat a.txt ## 测试数据 aaaaaa bbbbbb cccccc dddddd [root@PC1 test]# cat -A a.txt ## 包含多种形式的空行 aaaaaa$ bbbbb 阅读全文
posted @ 2025-11-26 16:03
小鲨鱼2018
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摘要：
001、 [root@PC1 test]# ls a.txt b.txt [root@PC1 test]# cat a.txt aaaaaa bbbbbb cccccc dddddd eeeeee ffffff gggggg [root@PC1 test]# awk 'NF==0{if(prev== 阅读全文
posted @ 2025-11-26 15:58
小鲨鱼2018
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001、 dat <- c("genome3_genomic.fna", "genome1_genomic.fna", "genome2_genomic.fna") ## 测试字符串 dat class(dat) dat sub("_genomic.fna", "", dat) ## 删除字符串向量 阅读全文
posted @ 2025-11-26 15:32
小鲨鱼2018
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