2025年5月31日
plink 软件中顾虑掉最小等位基因组数目出现次数少于一定个数的位点
摘要： 001、 plink --file outcome --mac 4 --recode tab --out xxx 阅读全文
posted @ 2025-05-31 18:04 小鲨鱼2018 阅读(8) 评论(0) 推荐(0)
plink 格式中提取包含杂合位点的SNP位点
摘要： 001、 (base) [b20223040323@admin2 test5]$ ls ## 测试数据 outcome.map outcome.ped (base) [b20223040323@admin2 test5]$ cat outcome.ped DOR 1 0 0 0 -9 G G C C 阅读全文
posted @ 2025-05-31 17:31 小鲨鱼2018 阅读(24) 评论(0) 推荐(0)
bcftools软件实现对vcf格式文件进行个体ID的重命名
摘要： 001、bcftools软件实现对vcf格式文件进行个体ID的重命名(vcf 文件可以是压缩格式） bcftools reheader -s rename.txt -o NC_082741_y_male_step4.vcf NC_082741_y_male_step3.vcf rename.txt格 阅读全文
posted @ 2025-05-31 16:31 小鲨鱼2018 阅读(67) 评论(0) 推荐(0)