Linux 中根据SRA号获取样本的详细信息

 

001、命令

epost -db sra -input a.txt -format acc | esummary -format runinfo > runinfo.csv

 

002、input format

(base) [b20223040323@admin2 014_talbe]$ cat a.txt
ERR313207
ERR340339
SRR5602566
SRR5803156
SRR5803167
SRR5803175
SRR5803217
SRR5803222
SRR5803223