bwa + samtools软件比对在4、16、30线程机时费用测试对比

 

001、bwa + samtools软件比对在4、16、30线程机时费用测试对比

依次修改线程数为4、16、30：

bwa mem -t 4 -M -R "@RG\tID:sample_name\tPL:illumina\tSM:sample_name" /PATH/GCF_016772045.2_ARS-UI_Ramb_v3.0_genomic.fna sample_name_trim_1P.fastq.gz sample_name_trim_2P.fastq.gz | samtools view -@ 4 -Sb - > sample_name.bam

 

 

002、测试结果

 

01、 按照0.08元一个机时计算，费用相差不大，线程数目越多，运算速度越快。