Trimmomatic 软件质控线程数目测试

 

分别是用1、2、4、8、16、30线程数目进行测试

 

001、测试程序

java -jar /public/home/b20223040323/software/trimmomatic/trimmomatic-0.39.jar PE -threads 4 127M_1.fq.gz 127M_2.fq.gz -baseout /public/home/b20223040323/test6/4_threads/02_clean/127M_trim.fastq.gz ILLUMINACLIP:/public/home/b20223040323/software/trimmomatic/adapters/TruSeq3-PE-2.fa:2:30:10:1 LEADING:20 TRAILING:20 SLIDINGWINDOW:4:15 MINLEN:50

 

调整线程数目分别为：1、2、4、6、8、16、30

运算时间如下：

 

01、线程为1时，运算时长最长，费用最低。 

02、线程为30时，运算时长最短，费用最高，跟线程为1时相差10倍。

03、线程为8时，运算速度已经没有明显增长。

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