eggnog 注释软件的安装

 

使用conda安装

001、创建单独的环境名称

 

(base) [root@pc1 test01]# conda create -n eggnog

 

002、查看环境

(base) [root@pc1 test01]# conda env list
# conda environments:
#
base                  *  /root/anaconda3
eggnog                   /root/anaconda3/envs/eggnog        ## 这里

 

003、激活eggnog环境

(base) [root@pc1 test01]# source activate eggnog
(eggnog) [root@pc1 test01]# ls

 

004、安装 eggnog-mapper

(eggnog) [root@pc1 test01]# conda install -c bioconda eggnog-mapper

 

005、软件调用测试

(eggnog) [root@pc1 test01]# download_eggnog_data.py --version      ## 调用测试
usage: download_eggnog_data.py [-h] [-D] [-P] [-M] [-H] [-d HMMER_DBS] [-y]
                               [-f] [-s] [-q] [--data_dir]
download_eggnog_data.py: error: unrecognized arguments: --version

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