python - 随笔分类(第15页) - 小鲨鱼2018

python 中常用的字符串处理函数03

摘要：001、istitle：判断是否为标题化字符串（所有单词第一个字母大写，其余小写） >>> a = "Abc Mn" >>> a.istitle() ## 判断字符串是否为标题化字符串 True >>> b = "abc mn" >>> b.istitle() False >>> c = "abc 阅读全文

posted @ 2022-05-22 19:48 小鲨鱼2018 阅读(82) 评论(0) 推荐(0)

python 中常用的字符串处理函数02

摘要：001、startswith、endswith：判定字符串是否以指定字符串开头或者结尾 >>> a = "abcdxyz" >>> a.startswith("a") ## 判定字符串是否以指定字符开头 True >>> a.startswith("b") False >>> a = "abcdef 阅读全文

posted @ 2022-05-22 19:05 小鲨鱼2018 阅读(104) 评论(0) 推荐(0)

python 中常用的字符串处理函数01

摘要：001、capitalize：将字符串的第一个字符改为大写，其他字符全部改为小写 >>> a = "abc" >>> b = "ABC" >>> c = "aBc" >>> a.capitalize() ## 将字符串的第一个字符改为大写，其他字符全部改为小写 'Abc' >>> b.capital 阅读全文

posted @ 2022-05-22 00:26 小鲨鱼2018 阅读(95) 评论(0) 推荐(0)

python 中提取以指定字符开头、结尾的数据

摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# cat a.txt d u s x e j z c e e f a z x e w f e 2、提取以z开头的数据 root@PC1:/home/test2# ls a.txt test.py root@PC1:/home/test2# ca 阅读全文

posted @ 2022-05-22 00:00 小鲨鱼2018 阅读(1069) 评论(0) 推荐(0)

python 中提取包含指定字符串的数据

摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test2# ls a.txt root@PC1:/home/test2# cat a.txt d u s x e j z c e e f a x f e w f e 2、提取包含字符x的数据 root@PC1:/home/test2# ls a.txt 阅读全文

posted @ 2022-05-21 00:15 小鲨鱼2018 阅读(1378) 评论(0) 推荐(0)

python中查找字符串

摘要：1、测试1 >>> seq = 'ATGTGACCCTGATTTTGAATGatgAtgAtGaTGaTg' ## 定义测试字符串 >>> type(seq) <class 'str'>= 使用find查找： >>> seq.find('ATG') ## 返回查找字符串的第一个索引 0 >>> se 阅读全文

posted @ 2022-03-20 23:21 小鲨鱼2018 阅读(1204) 评论(0) 推荐(0)

python中对列表元素去重复

摘要：1、测试数据 >>> test1 = ["aa", "bb", "aa", "cc", "cc", "dd", "aa"] ## 测试数据 >>> test1 ['aa', 'bb', 'aa', 'cc', 'cc', 'dd', 'aa'] >>> type(test1) <clas 阅读全文

posted @ 2022-02-08 18:00 小鲨鱼2018 阅读(291) 评论(0) 推荐(0)

python中列表切片的常用方法

摘要：1、测试数据 >>> test1 = ["aa", "bb", "cc", "dd", "ee", "ff", "gg", "hh"] ## 测试数据，8个元素 >>> test1 ['aa', 'bb', 'cc', 'dd', 'ee', 'ff', 'gg', 'hh' 阅读全文

posted @ 2022-02-08 17:53 小鲨鱼2018 阅读(525) 评论(0) 推荐(0)

python中实现字典的合并

摘要：1、使用内置函数update合并 >>> dict1 = dict(a = 100, b = 200, c = 300) ## 字典1 >>> dict1 {'a': 100, 'b': 200, 'c': 300} >>> dict2 = dict(d = 400, e = 500, f = 60 阅读全文

posted @ 2022-02-05 18:13 小鲨鱼2018 阅读(656) 评论(0) 推荐(0)

python中将fasta文件按照每行指定碱基数输出

摘要：1、测试数据test.fa （一共两条染色体） >OR4F5_ENSG00000186092_ENST00000641515_61_1038_2618 CCCAGATCTCTTCAGTTTTTATGCCTCATTCTGTGAAAATTGCTGTAGTCTCTTCCAGTTATGAAGAAGGTAAC 阅读全文

posted @ 2022-02-02 22:57 小鲨鱼2018 阅读(803) 评论(0) 推荐(0)

python IDLE 中快速清除变量快捷键

摘要：1、测试 ctrl + F6(快捷键） >>> list1 = ["aaa", "bbb", "ccc", "ddd"] >>> list1 ['aaa', 'bbb', 'ccc', 'ddd'] >>> type(list1) <class 'list'> >>> ## 此处执行ctrl + F 阅读全文

posted @ 2022-02-02 21:52 小鲨鱼2018 阅读(230) 评论(0) 推荐(0)

python中如何提取文件的前几行

摘要：1、测试数据及脚本 root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# ls test.py test.txt root@DESKTOP-1N42TVH:/home/test# cat test.txt a 3 d s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root@ 阅读全文

posted @ 2022-01-03 00:27 小鲨鱼2018 阅读(1439) 评论(0) 推荐(0)

python中如何统计文件的行数

摘要：1、测试数据 root@PC1:/home/test# ls test.py test.txt root@PC1:/home/test# cat test.txt ## 测试数据 w r s f z s d g z c w d z d g g z c e w root@PC1:/home/test# 阅读全文

posted @ 2021-12-18 21:26 小鲨鱼2018 阅读(1461) 评论(0) 推荐(0)

python中pip命令的使用

摘要：python中pip命令主要用于安装和下载包安装：pip install package_name 卸载：pip uninstall pakage_name 以numpy包为例进行测试。 1、查看python版本 C:\Users\75377>python --version Python 3.8 阅读全文

posted @ 2021-12-08 23:21 小鲨鱼2018 阅读(933) 评论(0) 推荐(0)

python用于合并指定类型的文件

摘要：1、合并所有的.txt文件 root@PC1:/home/test# ls ## 测试数据 a.txt b.txt c.txt d.csv e.csv txt_combine.py root@PC1:/home/test# head a.txt b.txt c.txt d.csv e.csv ## 阅读全文

posted @ 2021-11-21 11:10 小鲨鱼2018 阅读(74) 评论(0) 推荐(0)

python遍历指定类型的文件

摘要：1、遍历以特定字符结尾的文件 root@PC1:/home/test# ls ## 测试文件类型 out1.csv out1.ped out2.csv out2.ped out3.csv out3.ped test1.txt test2.txt test3.txt traverse_file.py 阅读全文

posted @ 2021-11-21 10:57 小鲨鱼2018 阅读(429) 评论(0) 推荐(0)

python中查看当前工作目录、修改工作目录、列出当前目录下的所有文件、创建目录

摘要：1、查看当前工作目录 >>> import os ## 导入os包 >>> os.getcwd() ## 查看当前工作目录 'D:\\programs\\python\\Lib\\idlelib' 2、修改工作目录 >>> os.chdir("C:\\Users\\75377\\Desktop\\p 阅读全文

posted @ 2021-11-20 21:29 小鲨鱼2018 阅读(3456) 评论(0) 推荐(0)

python3 从gff文件提取指定基因信息

摘要：1、测试数据下载：ftp://ftp.ensemblgenomes.org/pub/plants/release-44/gff3/arabidopsis_thaliana/Arabidopsis_thaliana.TAIR10.44.chromosome.1.gff3.gz 2、测试： root@P 阅读全文

posted @ 2021-11-20 12:43 小鲨鱼2018 阅读(1181) 评论(0) 推荐(0)

python3 中读取、写入文件实现替换指令示例

摘要：1、测试 root@PC1:/home/test# ls a.txt test.py root@PC1:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 gataaaaaataaatagaaacaaaatcactgaagaaCCAGTGTGCCTGCTCAGGTCAGATGAAGCCAGA 阅读全文

posted @ 2021-11-20 11:16 小鲨鱼2018 阅读(259) 评论(0) 推荐(0)

python3中提取包含特定字符的行

摘要：1、测试 root@PC1:/home/test# ls a.txt test.py root@PC1:/home/test# cat a.txt ## 测试数据 a 3 d s 1 j z c m q e i 3 4 k h f 3 root@PC1:/home/test# cat test.py 阅读全文

posted @ 2021-11-19 23:27 小鲨鱼2018 阅读(286) 评论(0) 推荐(0)

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