R scholar和rentrez | NCBI和Google scholar文献数据挖掘

主要会用到两个R包：

rentrez: 'Entrez' in R
scholar: Analyse Citation Data from Google Scholar

RISmed 包可以查询 PubMed 数据库中的信息。

 

目的1：输入检索词，从GSE数据库中爬取附带的参考文献。

 

R scholar包，Guangchuang Yu开发

Provides functions to extract citation data from Google Scholar. Convenience functions are also provided for comparing multiple scholars and predicting future h-index values.

可以得到期刊的详细信息，调用的是Google Scholar的数据接口，这里简单演示一下提取期刊的IF功能。

library(scholar)
id <- get_publications("bg0BZ-QAAAAJ&hl")
impact <- get_impactfactor(journals=id$journal, max.distance = 0.1)
id <- cbind(id, impact)