摘要: 01 关于我们 | WHO WE ARE 《生物信息与育种》 是一个深耕生物信息学与现代智能育种技术的专业交流平台。 我们大概在2015年埋下种子,于2023年10月开始生根发芽、频繁更新。我们致力于将生物信息、AI大数据、云计算、高通量表型组等前沿交叉技术,真正应用于现代生物育种实践。 我们的愿景 阅读全文
posted @ 2026-04-29 14:54 生物信息与育种 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 辞职有一阵子了,陆续有朋友好奇,问我怎么出来了。 现在回过头看这个选择,原因挺多,挑些能说的聊聊。 打工的目的说白了就是要给自己赎身,不可能打一辈子,也没有哪个公司能让你安安稳稳待到退休。 为什么不去体制?之前不是没想过,但靠那份收入养不活一家人。 如今已过35,此路不通。 再说,这世上只有相对的稳 阅读全文
posted @ 2026-04-29 14:48 生物信息与育种 阅读(201) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 最近一直在忙,但之前立的这个 flag 还是要补上,毕竟金三银四也快过去了。 从科研到打工,再到带团队,最后出来自己做,我在生信这一行前后十多年,面过的人不算少,也接触过各种背景的候选人,包括名校博士和博后。 这篇就从一个业务面试官的角度,聊一聊我通常怎么面试生信工程师,以及我更看重什么能力。仅供参 阅读全文
posted @ 2026-04-13 09:44 生物信息与育种 阅读(44) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 前段时间有朋友让我们帮忙复现一篇文章中的GS方法,并提供定制化代码:详见上期:【项目案例】定制7种常见基因组选择(GS)模型的核心代码。 我们想反正都是主流算法,写完了不用也就荒废在那了,不如分享给其他有需要的朋友。当然,我们是商业化团队,是需要收一点费用的。 没想到还是有不少朋友对这个脚本感兴趣的 阅读全文
posted @ 2026-04-03 16:48 生物信息与育种 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 系列报告 基因组选择(GS)让育种进入预测时代 全基因组选择:理论探讨 基因组选择(GS)如何加速作物遗传增益? Computomics:利用先进的机器学习实现预测性植物育种 基因组选择:加速遗传增益,缩短育种周期 基因组选择在水稻育种中的应用与效果 【报告解读】构建可复制和可推广的基因组预测模型 阅读全文
posted @ 2025-10-26 20:21 生物信息与育种 阅读(345) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基因组选择技术正在改变动植物育种的节奏。通过全基因组分子标记估算育种值,育种家能够更早更准地锁定优良基因型,缩短育种周期,提升遗传增益。但随着研究深入,两个问题逐渐凸显:深度学习模型预测虽准,但内部逻辑难以解读;多数方法只给出单一预测值,无法评估结果的可信程度。 燕山大学孙瑾团队联合国际玉米小麦改良 阅读全文
posted @ 2026-05-22 10:27 生物信息与育种 阅读(2) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 植物基因组里藏着大量调控元件和结构信息,它们分布在编码区和非编码区,参与转录起始、可变剪接、染色质开放等关键过程。这些区域碱基组成不均、依赖关系长、交互复杂,传统窗口式模型很难捕捉全局上下文。 高通量测序数据越来越多,物种越来越广,我们急需一个能跨物种泛化、支持多任务学习的统一建模框架。 植物科学领 阅读全文
posted @ 2026-05-19 14:15 生物信息与育种 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 近期,山东农业大学刘红军联合内布拉斯加大学杨金良等团队在Nature Communicaitons 上发表研究论文:The incomplete dominance of gene expression controlled by Trans-eQTL hotspots contributes to 阅读全文
posted @ 2026-05-14 10:30 生物信息与育种 阅读(21) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 番茄是重要蔬菜与果实研究模式植物,经万年人工驯化形成现代品种。人工选择提升产量等性状,但造成遗传瓶颈、多样性降低与有害突变积累。当前育种转向风味与营养,亟需以基因组解析为基础的精准设计育种。 近日,南京农业大学园艺学院吴瑶瑶教授团队在园艺学顶刊Horticulture Research上在线了题为: 阅读全文
posted @ 2026-05-13 18:21 生物信息与育种 阅读(20) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遗传育种的核心目标之一。传统育种依赖多年多点田间表型筛选,周期长且成本较高。东北农业大学宁海龙教授团队近期在The Crop Journal发表研究,系统整合基因挖掘、基因组选择模型与计算机模拟育种技术,构建从基因定位到杂交组合优化的完整技术链条,为高蛋白大豆品种选育提供可 阅读全文
posted @ 2026-05-12 14:39 生物信息与育种 阅读(9) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 提高大豆籽粒蛋白含量是大豆遗传育种的核心目标之一。传统育种依赖多年多点田间表型筛选,周期长且成本较高。东北农业大学宁海龙教授团队近期在The Crop Journal发表研究,系统整合基因挖掘、基因组选择模型与计算机模拟育种技术,构建从基因定位到杂交组合优化的完整技术链条,为高蛋白大豆品种选育提供可 阅读全文
posted @ 2026-05-12 11:13 生物信息与育种 阅读(6) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 全基因组重测序技术凭借覆盖全面、检测精准的特点,已成为挖掘功能位点、解析性状遗传基础的重要工具。随着研究群体规模的持续扩大,面对畜禽、水产以及水稻、小麦、玉米、大豆等作物的大样本量数据,常规计算平台常面临资源紧张、分析周期长等问题,影响项目整体进度。 米源生物基于企业级高性能计算集群与优化并行策略, 阅读全文
posted @ 2026-05-11 18:07 生物信息与育种 阅读(9) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 最近和朋友聊到一个问题:为什么现在的大语言模型在解读基因组数据时,效果总差那么一点意思? 不是模型能力不够,也不是训练数据不足,问题可能出在数据格式本身。 比如我们用了十几年的VCF格式,设计初衷是让生物信息分析师能看懂、能处理。每一行记录的是与参考基因组的差异,配合大量的元数据和外部注释文件,人类 阅读全文
posted @ 2026-05-11 17:43 生物信息与育种 阅读(12) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 2025年10月,国际水稻研究所(IRRI)公开发布了其水稻育种现代化的核心成果——Onerice育种框架,其宣称该框架已在IRRI及其合作伙伴的育种网络中全面落地。那么,今天我们来了解一下这个Onerice育种框架到底是个什么。 基于OneRice开发的优质水稻品种,以适应优先市场细分。图片来源于 阅读全文
posted @ 2026-05-07 10:36 生物信息与育种 阅读(45) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 基因挖掘与性状定位是连接表型变异与底层核酸序列差异的关键桥梁。长沙米源生物科技有限公司依托高密度变异图谱与多组学生信算力,构建涵盖全基因组关联分析、高密度遗传图谱构建及极端混池分组分析的高效挖掘体系,旨在为复杂数量性状与单基因突变性状提供精确的分子标记与候选功能靶标。 一、基因挖掘核心服务体系 1. 阅读全文
posted @ 2026-05-06 15:17 生物信息与育种 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)