随笔分类 -  生信

可以用到的方法、思路、新发现等
摘要:把该错误投入chatgpt中会反映网络问题,重试几次 但我重试了好几天也没安上,重新搜索该报错发现: That HTTP error happened when I updated the conda with conda update conda. I tried all options disc 阅读全文
posted @ 2024-04-13 13:00 jcfaieng 阅读(311) 评论(0) 推荐(0)
摘要:001、使用conda安装bcftools, 调用报错如下: [root@PC1 ~]# conda install bcftools -c bioconda ## conda安装 [root@PC1 ~]# bcftools ## 调用测试 002、解决方法1 [root@PC1 ~]# cond 阅读全文
posted @ 2024-04-04 16:28 jcfaieng 阅读(1106) 评论(0) 推荐(0)
摘要:常见报错:参考基因组与VCF存在不匹配的contigs 处理方法: ①按照已有参考基因组更新VCF java -jar picard.jar UpdateVcfSequenceDictionary R=reference.fasta I=input.vcf O=output.vcf ②如后续不需要c 阅读全文
posted @ 2024-04-04 15:54 jcfaieng 阅读(577) 评论(0) 推荐(0)
摘要:遗传相关(Genetic Correlation)是遗传学核心概念,用于衡量表型之间由基因决定的相关性。 实现方法包括LDSC(连锁不平衡得分回归; https://github.com/bulik/ldsc)、HDL(高精度似然函数;https://github.com/bulik/ldsc)、G 阅读全文
posted @ 2023-06-21 10:21 jcfaieng 阅读(1146) 评论(0) 推荐(0)