随笔分类 -  文献追踪——MCP(2019年04月)

李琪丹组
MCP|LQ|DIAlignR provides precise retention time alignment across distant runs in DIA and targeted proteomics
摘要：文献名： DIAlignR provides precise retention time alignment across distant runs in DIA and targeted proteomics（DIAlignR 为DIA和靶向蛋白质组学提供了准确的保留时间对齐的算法） 期刊名：M 阅读全文
posted @ 2019-04-15 10:40 ilifeiscience 阅读(399) 评论(0) 推荐(0)
MCP|ZWT|Precision de novo peptide sequencing using mirror proteases of Ac-LysargiNase and trypsin for large-scale proteomics（基于Ac-LysargiNase和胰蛋白酶的蛋白组镜像de novo测序）
摘要：一、概述 由于难以获得100%的蛋白氨基酸序列覆盖率，蛋白组de novo测序成为了蛋白测序的难点，由Ac-LysargiNase（N端蛋白酶）和胰蛋白酶构成的镜像酶组合可以解决这个问题并具有稳定性，这2种消化位点互补的酶能够产生目标蛋白的镜像b,y离子，基于镜像原理设计的算法pNovoM可用于蛋白 阅读全文
posted @ 2019-04-15 10:14 ilifeiscience 阅读(454) 评论(0) 推荐(0)
MCP|WJ|Identification of candidate plasma protein biomarkers for cervical cancer using the multiplex proximity extension assay(利用多重邻位延伸分析技术进行宫颈癌血浆蛋白候选生物标记物的鉴定研究)
摘要：文献名：Identification of candidate plasma protein biomarkers for cervical cancer using the multiplex proximity extension assay(利用多重邻位延伸分析技术进行宫颈癌血浆蛋白候选生物标 阅读全文
posted @ 2019-04-15 09:04 ilifeiscience 阅读(1209) 评论(0) 推荐(0)
MCP|LDY|Mass Spectrometry-based Absolute Quantification of 20S Proteasome Status for Controlled Ex-vivo Expansion of Human Adipose-derived Mesenchymal Stromal/Stem Cells（基于质谱技术的20S蛋白酶体绝对定量方法监控人体脂肪...
摘要：期刊名：Mol Cell Proteomics 发表时间：（2019年4月） IF：5.232 概述 20S蛋白酶体是一种多亚基蛋白质复合物，参与许多组织细胞生命活动过程。本研究基于SILAC标记的蛋白酶体的MRM技术，以监测人体不同组织细胞中20S蛋白酶体亚型的绝对表达量。并将这种高准确性的SIL 阅读全文
posted @ 2019-04-14 23:39 ilifeiscience 阅读(361) 评论(0) 推荐(0)
MCP|ZCM|Investigating Lactococcus lactis MG1363 response to phage p2 infection at the proteome level（研究乳酸乳球菌MG1363在噬菌体p2感染后的蛋白质组水平变化）
摘要：一、概述： 噬菌体是特异性感染并最终杀死其细菌宿主的病毒。他们在所有生态系统中发挥着关键的生态作用。尽管经过了几十年的研究，噬菌体与细菌宿主之间的相互作用仍然知之甚少。本研究使用无标记定量蛋白质组学来揭示乳酸乳球菌MG1363在噬菌体p2感染过程中的蛋白质组类型；还使用了CRISPR-Cas9技术选 阅读全文
posted @ 2019-04-14 19:45 ilifeiscience 阅读(495) 评论(0) 推荐(0)
MCP|MZL|Accurate Estimation of Context- Dependent False Discovery Rates in Top- Down Proteomics 在自顶向下蛋白组学中精确设定评估条件估计假阳性
摘要：一、 概述： 自顶向下的蛋白质组学技术近年来也发展成为高通量蛋白定性定量手段。该技术可以在一次的实验中定性上千种蛋白，然而缺乏一个可靠的假阳性控制方法阻碍了该技术的发展。在大规模流程化的假阳性控制手段中，假阳性的判断取决于蛋白鉴定的检索条件，包括谱图的质量，检索的数据库的大小，检索引擎，检索参数等。 阅读全文
posted @ 2019-04-14 17:03 ilifeiscience
MCP|DYM|Quantitative mass spectrometry to interrogate proteomic heterogeneity in metastatic lung adenocarcinoma and validate a novel somatic mutation CDK12-G879V (利用定量质谱探究转移性肺腺瘤的蛋白质组异质性及验证新体细胞突变)
摘要：文献名：Quantitative mass spectrometry to interrogate proteomic heterogeneity in metastatic lung adenocarcinoma and validate a novel somatic mutation CDK1 阅读全文
posted @ 2019-04-14 13:34 ilifeiscience 阅读(329) 评论(0) 推荐(0)
MCP|XN|Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Proteome（肺炎杆菌通过整体重构蛋白质组降低抗生素敏感性）
摘要：文献名：Decreased Antibiotic Susceptibility Driven by Global Remodeling of the Klebsiella pneumoniae Proteome（肺炎杆菌通过整体重构蛋白质组降低抗生素敏感性） DOI：10.1074/mcp.RA11 阅读全文
posted @ 2019-04-13 23:12 ilifeiscience 阅读(236) 评论(0) 推荐(0)
MCP|BFY|Proteome Analysis of Human Neutrophil Granulocytes From Patients With Monogenic Disease Using Data-independent Acquisition（单基因疾病患者中性粒细胞的DIA蛋白质组分析）
摘要：文献名：Proteome Analysis of Human Neutrophil Granulocytes From Patients With Monogenic Disease Using Data-independent Acquisition（单基因疾病患者中性粒细胞的DIA蛋白质组分析） 阅读全文
posted @ 2019-04-13 19:17 ilifeiscience 阅读(362) 评论(0) 推荐(0)
MCP|XHK|High-density peptide arrays help to identify linear immunogenic B cell epitopes in individuals naturally exposed to malaria infection（高密度肽段阵列有助于在自然暴露于疟疾感染的个体中识别线性免疫原性B细胞表位）
摘要：文献名：High-density peptide arrays help to identify linear immunogenic B cell epitopes in individuals naturally exposed to malaria infection（高密度肽段阵列有助于在自 阅读全文
posted @ 2019-04-10 22:59 ilifeiscience 阅读(238) 评论(0) 推荐(0)
解读人：谭亦凡，Macrophage phosphoproteome analysis reveals MINCLE-dependent and -independent mycobacterial cord factor signaling（巨噬细胞磷酸化蛋白组学分析揭示MINCLE依赖和非依赖的分支杆菌索状因子信号通路）（MCP换）
摘要：发表时间：2019年4月 IF：5.232 一、 概述： 分支杆菌索状因子TDM（trehalose-6,6’-dimycolate）能够与巨噬细胞C-型凝集素受体（CLR）MINCLE结合引起下游通路变化。本文对TDM处理的巨噬细胞磷酸化蛋白质组进行定量分析，发现了依赖于MINCLE的信号通路和M 阅读全文
posted @ 2019-04-10 10:32 ilifeiscience 阅读(829) 评论(0) 推荐(0)
MCP|LQD|Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry （DIA方法可提升交联质谱定量分析）
摘要：文献名：Data-independent acquisition improves quantitative cross-linking mass spectrometry （DIA方法可提升定量交联质谱分析） 期刊名：Mol Cell Proteomics 发表时间：（2019年4月） IF：5. 阅读全文
posted @ 2019-04-09 16:46 ilifeiscience 阅读(1179) 评论(0) 推荐(0)