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摘要： 十几分钟就能跑通完整流程，快速拿到靶基因敲除后的全局扰动结果 阅读全文

摘要： 在单细胞转录组研究中，探究基因功能、解析调控通路、筛选潜在靶点是高频研究方向。传统基因敲除实验虽结果直观，但存在周期长、成本高、通量低、部分基因敲除致死等诸多痛点，极大限制了大规模候选基因筛选工作。 而虚拟敲除技术的出现，完美弥补了这一短板。翰佰尔生物近期围绕scTenifoldKnk虚拟敲除工具的 阅读全文

摘要： 本文适用人群：单细胞转录组初学者、需要批量挖掘GEO公共单细胞数据的科研从业者 适用数据类型：10X Genomics 标准单细胞数据（自测下机数据、GEO/SRA下载公共数据） 解决痛点：Seurat环境配置繁琐、版本冲突、代码报错、本地电脑内存不足 数据适配范围：全覆盖10X标准数据 该方案针对 阅读全文

摘要： 背景介绍 长期以来，小鼠等啮齿类动物凭借易于饲养和遗传背景清晰的优势，成为了实验室的绝对主角，但由于它们与人类在进化上相去甚远，许多免疫学研究成果在转化到人体时往往面临瓶颈。在这个背景下，树鼩——一种在外形上酷似松鼠，但在基因组结构、生物化学代谢以及神经和免疫系统上却与灵长类动物有着极高相似性的独特 阅读全文

摘要： 《Horticulturae》文章“Exploring the Genomic Landscape: A Comprehensive Analysis of the Genetic Diversity and Population Structure of Thai Tomato WGS”SNP密度 阅读全文

摘要： 单细胞水平解析m6A修饰一直存在数据分散、方法差异大的问题，实际使用中往往需要研究者自行整合数据、编写代码分析，门槛较高。在此基础上，最新研究在完成多种单细胞m6A识别方法系统评估的同时，进一步推出了一个面向应用的在线平台——Scm6A数据库。 Scm6A的核心价值在于把原本分散在不同技术体系下的数 阅读全文

摘要： 本文整理的生物信息学数据库基本覆盖了生信研究最常见的数据资源。如果你经常进行单细胞分析、转录组分析、宏基因组分析或蛋白质组研究，建议收藏作为常用工具参考。 阅读全文

摘要： 随着高通量组学数据的爆炸式增长，目前针对同一物种的各类组学数据（如基因组、表观组、转录组、蛋白质组、代谢组等）散布于众多平台和文献之中。由于缺少统一的存储标准和整合机制，科研人员难以从海量已发表数据中高效提取有用信息。 为此，构建一个全面的多组学数据集中存储与分析数据库显得尤为重要。该数据库通过标准 阅读全文

摘要： GEO数据库构成： 1. GEO Platform (GPL)芯片平台 定义：描述实验使用的芯片或测序技术平台。 内容：包含探针与基因的对应关系、平台设计参数等元数据。 示例：GPL570（Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array）。 2. GEO Sa 阅读全文

摘要： GSEA富集分析的基本原理是使用预定义的基因集 （例如：铁死亡通路，只要能获取到相关基因，就能定义成一个基因集），将基因按照在两类样本中的差异表达程度进行排序，然后检验这些预先设定的基因集合是否在这个排序表的顶端或者底端富集。如果基因集在排序列表的顶部富集 （即上调），如果在底部富集 （即下调）。f 阅读全文