摘要:
总结起来就三句话: (1)当同一个数据集有n次(n>=2)假设检验时,要做多重假设检验校正 (2)对于Bonferroni校正,是将p-value的cutoff除以n做校正,这样差异基因筛选的p-value cutoff就更小了,从而使得结果更加严谨 (3)FDR校正是对每个p-value做校正,转 阅读全文
posted @ 2019-01-08 17:49
何弈
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摘要:
matlab自带函数mafdr,当ttest数较多时,可直接用[FDR, Q]=mafdr(P);但是Storey procedure在p值少于1000个时会崩溃,此时应改用BH FDR方法:mafdr(P,'BHFDR', true)。该方法对于少量ttest更稳健,但是更保守。 参考链接: ht 阅读全文
posted @ 2019-01-08 17:40
何弈
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