摘要:
原生bash不支持简单的数学运算,但是可以通过其他命令来实现,例如 awk 和 expr,expr 最常用。 expr 是一款表达式计算工具,使用它能完成表达式的求值操作。 例如,两个数相加(注意使用的是反引号 ` 而不是单引号 '): #!/bin/bash val=`expr 2 + 2` ec 阅读全文
摘要:
我们可以在执行 Shell 脚本时,向脚本传递参数,脚本内获取参数的格式为:$n。n 代表一个数字,1 为执行脚本的第一个参数,2 为执行脚本的第二个参数,以此类推…… 以下实例我们向脚本传递三个参数,并分别输出,其中 $0 为执行的文件名: #!/bin/bash echo "Shell 传递参数 阅读全文
摘要:
sra文件转换为fastq格式 fastq-dump -h --split-3 也就是说如果SRA文件中只有一个文件,那么这个参数就会被忽略。如果原文件中有两个文件,那么它就会把成对的文件按*_1.fastq,*_2.fastq这样分开。如果还出现了第三个文件,就意味着这个文件本身是未成配对的部分。 阅读全文