摘要: 热图是使用颜色来展示数值矩阵的图形。通常还会结合行、列的聚类分析,以表达实验数据多方面的结果。 热图在生物学领域应用广泛,尤其在高通量测序的结果展示中很流行,如样品-基因表达,样品-OTU相对丰度矩阵非常适合采用热图呈现。 热图优点 因为人读数字需要思考和比较,而对颜色识别能力非常强,采用颜色的深浅 阅读全文
posted @ 2017-08-02 23:25 弗雷赛斯 阅读(6889) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 散点图 数据点在直角坐标系平面上的分布图。在宏基因组领域,散点图常用于展示样品组间的Beta多样性,常用的分析方法有主成分分析(PCA),主坐标轴分析(PCoA/MDS)和限制条件的主坐标轴分析(CPCoA/CCA/RDA)。 Beta多样性 Beat多样性是生态学概念,专指不同组或生态位间物种组成 阅读全文
posted @ 2017-08-02 23:24 弗雷赛斯 阅读(4442) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 查看默认安装包的位置 移除包 remove.packages("package_name") 查看所有安装的包 移除包 remove.packages("package_name") 查看所有安装的包 按 q 退出包列表 获取当前在R环境中加载的所有包 search() 获取当前在R环境中加载的所有 阅读全文
posted @ 2017-08-02 16:58 弗雷赛斯 阅读(499) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 有时候可能想分解出某些值然后丢弃它们,可以使用诸如 _ 或者 ign(ignored)等常用来表示待丢弃值的变量名: record = ('ACME', 50, 123.45, (12, 18, 2012))name, *_, (*_, year) = recordprint(name)print( 阅读全文
posted @ 2017-08-02 09:38 弗雷赛斯 阅读(1277) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 如果要进行整除,使用 // 运算符,它将返回商的整数部分 >>> 4 // 3.01.0 Python中单行注释以 # 开头,例如: 多行注释用三个单引号 ''' 或者三个双引号 """ 将注释括起来,例如: '''这是多行注释,用三个单引号这是多行注释,用三个单引号 这是多行注释,用三个单引号'' 阅读全文
posted @ 2017-08-02 09:33 弗雷赛斯 阅读(354) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 1、下载jdk8 登录网址:http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/jdk8-downloads-2133151.html 选择对应jdk版本下载 2、解压 3、然后将文件夹jdk1.8.0_144移动到目录/opt下 4、修改 阅读全文
posted @ 2017-08-02 09:32 弗雷赛斯 阅读(21667) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要: 启动docker docker安装后出现Cannot connect to the Docker daemon You need to add user into docker group. by 'sudo gpasswd -a xxxx docker' (xxx is your user nam 阅读全文
posted @ 2017-08-02 09:15 弗雷赛斯 阅读(3431) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 登录Linux系统后,呈现在眼前的是这样一个界面: fs@ehbio:~$ 首先解释下出现的这几个字母和符号: fs:用户名 ehbio:如果是登录的远程服务器,则为宿主机的名字 ~:代表家目录, 在我们进入新的目录后,这个地方会跟着改变 $:用来指示普通用户输入命令的地方;对根用户来说一般是 # 阅读全文
posted @ 2017-08-02 09:01 弗雷赛斯 阅读(462) 评论(0) 推荐(0) 编辑