摘要:
以下分析用到的数据可以在这里(http://dl.getdropbox.com/u/308058/blog/raw_data_3_replicates.txt )下载,这个数据来自关于基因对蝴蝶迁移性的研究,样本是20个蝴蝶个体,其中10个是当地固有个体(old),另外10个是新迁入的个体(new),old和new个体两两随机配对,分别用不同颜色染料(波长分别为555和647nm)标记后,在同一张基因芯片上杂交;此外,每个基因在每张芯片上都重复点样3次,因此此数据是有3个replicates及10张芯片的双通道芯片。数据是样点的信号强度值,没有经过标准化处理的。拿到数据你会看到许多”NA”,这 阅读全文
posted @ 2012-12-05 15:09
emanlee
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摘要:
R是开源的统计计算和作图语言,与S语言很相似。R的语法与其他语言很相似,功能很强大,可以到这里看看截图。主页是 http://www.r-project.org/ 可以点击这里下载R,这里有很权威的英文教程。本站提供几本中文教程(pdf)的打包下载,更多的随便搜索一下就可以找到。 BioConductor是建立在R语言环境上的生物芯片数据和基因组数据分析软件包,主页是 http://www... 阅读全文
posted @ 2012-12-05 14:33
emanlee
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摘要:
bioconductor 包的安装安装R,并启动R。 > source("http://bioconductor.org/biocLite.R") > biocLite() Using R version 2.10.0 (R-devel), biocinstall version ... 阅读全文
posted @ 2012-12-05 00:19
emanlee
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