SNP间的上位效应

传统的全基因组关联分析(GWAS)计算的是单个SNP与表型的相关性,除此之外,我们还可以进行SNP之间的互作效应与表型的相关性分析。

上位效应的公式为:Y ~ b0 + b1.A + b2.B + b3.AB + e

Y为表型,A和B分别为两个变异位点,在GWAS中通常指SNP,如果b3为显著,则说明存在上位效应。

 

 

REF

https://www.cnblogs.com/chenwenyan/p/13813946.html

 

posted @ 2023-10-15 10:21  emanlee  阅读(45)  评论(0编辑  收藏  举报