随笔列表第157页 - emanlee

2015年10月11日

摘要： tophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR222.fastqtophat -p 4 -G filter.gtf \-o /SRR222 \/index \SRR717.fastq,SRR718.fastqtophat -p 4 -G filt... 阅读全文

posted @ 2015-10-11 21:49 emanlee 阅读(502) 评论(0) 推荐(0) 编辑

echo输出到stderr

摘要： echo "Your error message here" >&2 This is a normal echo (which goes to stdout), however the>&2(which is shorthand for1>&2), means 'mix the stdout to ... 阅读全文

posted @ 2015-10-11 15:41 emanlee 阅读(940) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2015年10月1日

随机森林

摘要： http://www.36dsj.com/archives/32820简介近年来，随机森林模型在界内的关注度与受欢迎程度有着显著的提升，这多半归功于它可以快速地被应用到几乎任何的数据科学问题中去，从而使人们能够高效快捷地获得第一组基准测试结果。在各种各样的问题中，随机森林一次又一次地展示出令人难以置... 阅读全文

posted @ 2015-10-01 21:07 emanlee 阅读(26382) 评论(0) 推荐(2) 编辑

数据科学家应该掌握的5个工具

摘要：本文转自：http://www.36dsj.com/archives/34020当谈及到分析你编纂的数据时，有大量的工具可以帮助你更好的理解数据，本文总结出了一个包括5个数据科学工具的列表，同时这也是你在当今的社会形势下人们应该掌握的5个数据科学工具。即使是知识渊博的数据科学家也能提升他们的技术水平... 阅读全文

posted @ 2015-10-01 19:38 emanlee 阅读(822) 评论(0) 推荐(0) 编辑

6个用于大数据分析的最好工具

摘要：本文转自：http://www.d1net.com/bigdata/news/334735.html大数据是一个含义广泛的术语，是指数据集，如此庞大而复杂的，他们需要专门设计的硬件和软件工具进行处理。该数据集通常是万亿或EB的大小。这些数据集收集自各种各样的来源：传感器，气候信息，公开的信息，如杂志... 阅读全文

posted @ 2015-10-01 19:35 emanlee 阅读(1109) 评论(0) 推荐(0) 编辑

55个最实用大数据可视化分析工具

摘要：该文转自【IT168 技术】近年来，随着云和大数据时代的来临，数据可视化产品已经不再满足于使用传统的数据可视化工具来对数据仓库中的数据抽取、归纳并简单的展现。传统的数据可视化工具仅仅将数据加以组合，通过不同的展现方式提供给用户，用于发现数据之间的关联信息。新型的数据可视化产品必须满足互联网爆发的大数... 阅读全文

posted @ 2015-10-01 19:33 emanlee 阅读(903) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2015年9月21日

统计tophat map上的read数量

摘要： samtools flagstat /SRA111111/SRR111222/accepted_hits.bam 78406056 + 0 in total (QC-passed reads + QC-failed reads) (1)0 + 0 duplicates78406056 + 0 map 阅读全文

posted @ 2015-09-21 19:46 emanlee 阅读(1364) 评论(0) 推荐(0) 编辑

统计fastq文件中读段的数量

摘要： mycount=`cat SRR108114_new_1.fastq | wc -l` echo 'Number of clean reads, SRR108114_new_1.fastq: '$((mycount/4)) >> SRR108114.stat mycount=`cat SRR1081... 阅读全文

posted @ 2015-09-21 18:36 emanlee 阅读(995) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2015年9月16日

傅里叶变换

摘要： http://blog.jobbole.com/70549/ 阅读全文

posted @ 2015-09-16 13:20 emanlee 阅读(613) 评论(0) 推荐(0) 编辑

2015年9月15日

果蝇优化算法

摘要： REF:http://download.csdn.net/detail/wangjiquan8037/3760685http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0950705111001365 (2区) 阅读全文

posted @ 2015-09-15 19:06 emanlee 阅读(2002) 评论(0) 推荐(0) 编辑