做完creation之后，我的MM 能量出现很大问题，能量太大了。

 

 后来发现是我的氨基酸出现问题。因此必须重新检查氨基酸。所以我花了一个晚上检查氨基酸重叠现象，加上老师说的两个问题。

老师告诉我用debug_rank_e=on，在MM那一步查找问题。其实问题是之前的问题，所以最好setup那里一定要细心。不能出现重叠现象。所以从一开始就检查一下所有的氨基酸，不要相信程序，除非以后自己做出pyhon程序检查原子之间的距离。

不知道自己为何问题这么多，可能是因为太笨了吧。

后来解决重叠现象（mini这一步，bynu命令控制原子），heat300k这里也好了。之前加水跑平衡那里heat 300K发生错误的原因也是因为氨基酸重叠。所以这次重新做了跑平衡就没有出问题，也不需要改inp文件就正常跑完了。

现在重新回到creation这里。加油吧，希望之后的问题不要那么多。平常多检查一下自己的氨基酸问题。