摘要:
在经过前面几篇博客的介绍之后,我们可以定义一些目标的分子体系,并且计算其单点能。而分子模拟的精髓就在于快速的迭代和演化,也就是本文所要介绍的迭代器相关的内容。在具备了分子系统、单点能和迭代器这三者之后,就可以正式开始进行分子动力学模拟。常见的模拟过程有:能量极小化、NVT恒温恒容过程、NPT恒温恒压过程以及NVE微正则系综,本文所涉及的主要是能量极小化以及NVT恒温恒容过程,更多的模拟方法有待大家一起研究探讨。 阅读全文
在经过前面几篇博客的介绍之后,我们可以定义一些目标的分子体系,并且计算其单点能。而分子模拟的精髓就在于快速的迭代和演化,也就是本文所要介绍的迭代器相关的内容。在具备了分子系统、单点能和迭代器这三者之后,就可以正式开始进行分子动力学模拟。常见的模拟过程有:能量极小化、NVT恒温恒容过程、NPT恒温恒压过程以及NVE微正则系综,本文所涉及的主要是能量极小化以及NVT恒温恒容过程,更多的模拟方法有待大家一起研究探讨。 阅读全文
posted @ 2023-09-04 17:38
DECHIN
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