摘要:本文介绍了一款基于python语言的SMILES化学表达式的读写SDK,使用openSMILES表达式所定义的分子结构是非常精简的,但是其中的规则又非常的多,因此使用一款友好的SMILES表达式能够大大的缩减解析的成本。并且pysmiles结合了一款非常常用的python的拓扑网络结构表示SDK——networkx,使得对SMILES表达式的结果分析更加的人性化。 阅读全文
posted @ 2021-05-10 10:54 陆言君 阅读(170) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:推荐一款在Ubuntu Linux下挺好用的PDF阅读器——Okular 阅读全文
posted @ 2021-05-08 11:20 陆言君 阅读(8) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:本文重点介绍了VMD分子动力学模拟可视化软件的安装与基本使用方法,VMD是一款非常小而精致的可视化工具,在业界也备受推崇。如果只是用于做分子模型的展示,功能是完全足够的,如果要执行更多的操作,需要掌握tcl语言,当然这也是一个坑点。 阅读全文
posted @ 2021-05-07 15:19 陆言君 阅读(81) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:继上一篇文章介绍了MindSpore的CPU版本的Docker容器化部署之后,MindSpore官方团队推出了MindSpore的GPU版本的Docker容器化部署方案,本文针对这一方案进行了安装测试,并且对于其中一些安装的时候可以遇到的问题的细节进行了处理。之所以采用容器化的解决方案,主要是为了做到SDK环境与编程环境的隔离,释放本地环境配置与部署的压力。当然,也使得本地的开发环境更加的“干净”。 阅读全文
posted @ 2021-05-06 16:26 陆言君 阅读(174) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:本文按照操作流程的时间顺序,分别介绍了Gitlab的Docker容器部署、Gitlab平台的基本配置以及基于Git的代码仓基本管理与同步方法。通过掌握这一套的流程,就可以实现在本地构建一个类似于Github的代码托管系统,在企业内网更好的管理私有代码仓库,避免因为在Github上进行代码开发而被其他企业窃取核心技术。 阅读全文
posted @ 2021-05-05 19:48 陆言君 阅读(264) 评论(0) 推荐(1) 编辑
摘要:本文主要展示了一些lambda表达式的使用示例,通过这些示例,我们可以了解到lambda表达式的常用语法以及使用的场景。在一般情况下,其最大的意义还是简化了python中函数的定义方式,在可读性上远不如def所定义的函数。 阅读全文
posted @ 2021-05-04 21:17 陆言君 阅读(28) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:本文介绍了python的迭代器yield,其实关于yield,我们可以简单的将其理解为单个元素的return。这样不仅就初步理解了yield的使用语法,也能够大概了解到yield的优势,也就是在计算过程中每次只占用一个元素的内存,而不需要一直存储大量的元素在内存中。 阅读全文
posted @ 2021-05-04 19:29 陆言君 阅读(125) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:为了使得输入参数的可扩展性更好,python中自带了args和kwargs两种方法,可以用于表示一个tuple类型的可变长度入参。其中args是一系列的一元变量的输入,kwargs是一系列键值对的输入,可以认为是一个二元变量的输入。虽然这两种方案也都可以用自行实现的tuple来替代,但是直接使用这两种定义会节省很多自定义可变入参的繁琐。 阅读全文
posted @ 2021-05-03 19:29 陆言君 阅读(80) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:在科学计算中对于恒定不变的数据,不一定需要实时保存在内存中,或者是需要跨平台运算的数据,我们可以将其保存为numpy格式的列表文件npy或者npz。而如果存储的文件过大,本文也额外介绍了简单的tar压缩与解压缩的使用方法。 阅读全文
posted @ 2021-05-02 19:21 陆言君 阅读(103) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要:本文通过简单演示,介绍了在Manjaro Linux系统下设置变更主机名的方法,包含有临时方法和永久生效的方法。这些方法在Linux系统中应该是可以通用的,不仅仅局限在Manjaro Linux中。 阅读全文
posted @ 2021-04-19 15:06 陆言君 阅读(16) 评论(0) 推荐(0) 编辑