Dechin的博客

摘要： 通过斐波那契晶格生成算法，我们可以在一个任意半径的球体表面进行均匀采样，得到给定的N个坐标点。基于这个晶格生成算法，可以对整个分子的所有原子做斐波那契晶格生成，再剔除共用的格点，即可得到分子表面（SASA）的均匀格点分布。 阅读全文

摘要： 分子动力学模拟是基于传统的分子力场，对分子构象进行不断迭代演化的一个过程。虽然计算量相比于量子化学已经缩减了很多，但是由于大型分子体系下近邻表的存在，以及PME算法本身的复杂性，所以实际上分子动力学模拟工具的计算性能，会是使用者最为关注的要点之一。SPONGE版本可以支持GPU加速的分子动力学模拟计算，凭借其极高的效率以及模块化的设计，在一众的分子模拟软件中脱颖而出。本文着重介绍SPONGE-2.0版本的安装与基本使用。 阅读全文

摘要： 对于长效分子动力学模拟来说，如何去高效的存储分子轨迹，是一个重要的问题。前者有Gromacs的xtc格式文件，利用量化和比特级的压缩，将分子轨迹压缩到23%左右。而本文介绍的mdc工具，可以在xtc的基础上，再压缩到60%左右。 阅读全文

摘要： Latex Beamer是我个人非常喜欢的一个演示文稿风格，该文稿类型，不仅对于公式、代码块有很好的展示效果，同时在演示文稿的架构上有非常清晰的层次感，甚至可以直接支持mermaid这样的流程图，内容专业而丰富。所以我也一直有在探索有什么工具可以更好的结合Markdown的简明语法和Latex Beamer的专业演示，从这点上来说，我觉得Zettlr是一个不错的开始。 阅读全文

摘要： 本文主要介绍一个在sglang启用本地大模型进行对话之后，远程清除对话缓存的一个指令。可以在闲时或者有紧急任务时，释放出一部分的显存出来作其他用途。 阅读全文

摘要： 在往期关于DeepSeek的模型部署、KTransformer的安装与使用、PageAssist和OpenClaw的相关应用部署的基础之上，本文我们再讲述一个新版的KTransformer部署最新的BF16精度的Qwen3-Coder-Next模型的一些技术方案和操作指引。 阅读全文

摘要： 接上一篇关于Docker中的Ollama养虾的文章之后，这里补充一个Docker中部署Ollama模型的方案，通过这种方式建立一个完整的虚拟化环境，确保Ollama和OpenClaw在环境内的操作都相对可控。 阅读全文

摘要： 本文介绍了一种在Win11操作系统下，使用Docker部署OpenClaw的一种方案，并且Token由本地部署的Ollama加载开源的qwen3.5模型产生，实现零成本、相对安全可控的一种部署方案。当然，目前OpenClaw和Ollama的安全性还是有待提升，结合自己的情况，慎重部署！！！ 阅读全文

摘要： 本文介绍了一个可能在Win11的自动更新之后出现的严重问题：由于显卡驱动被更新了，原本安装在WSL2和Docker中的GPU环境因为版本不适配的问题，会无法识别GPU（虽然在Nvidia-Smi中可以看到，也可以用nvcc编译，但正常使用会报错）。通过手动降驱动版本，可以解决该问题。 阅读全文

摘要： 本文通过具体代码实现，介绍了一种在Python中，使用numpy对原始数据进行固定长度的等间距抽样方法。 阅读全文

摘要： 本文介绍了一个使用python进行免费pdf文档合并的实现方案。使用该方案，还可以针对同一个路径下的多个文件进行合并操作，还可以利用Python的正则表达式对文件名进行筛选。综合来说，该工具对于熟练使用Python的人来说，是一大办公福音。 阅读全文

摘要： 接前面一篇关于键长和键角的相互作用力计算的文章，本文简单的计算了一下传统分子力场项中常见的二面角项的相互作用力。 阅读全文

摘要： 本文通过一个简单的微分计算，说明了为什么弹簧对两头的作用力方向总是沿着弹簧方向的。虽然是一个固有的认知，但其实也可以通过简单的计算来进行论证。 阅读全文

摘要： 本文介绍了一种使用conda来安装gcc和g++编译工具的方法，可以不需要root权限，也能够在本地自己的路径下配置相应的编译器版本。 阅读全文

摘要： 本文介绍了一个Ubuntu操作系统下如何挂载新硬盘，并配置重启开机默认挂载的流程和方法。 阅读全文