2022年8月4日
在VMD上可视化hdf5格式的分子轨迹文件
摘要： 在VMD上可视化hdf5格式的分子轨迹文件 相比于明文存储和传统的一些数据存储方法，HDF5格式的文件非常适合用于存储分子动力学模拟过程中产生的庞大轨迹文件，不仅有良好的可读性，还有非常优秀的压缩率，使得存储下来的轨迹文件不至于太大。而相应的，我们也需要一些配套的可视化软件，用来展示HDF5文件中存储的内容。本文所介绍的改进版的VMD-h5mdplugin插件，可以在VMD中直接展示HDF5的分子运动轨迹，并给出了相应的案例。 阅读全文
posted @ 2022-08-04 15:47 DECHIN 阅读(743) 评论(0) 推荐(1) 编辑