摘要：本文通过对pyvista这一相对“冷门”的python三维可视化工具的摸索，总结了安装与基本的使用示例，包括单模块、多模块、静态图、动态画板、gif和mp4视频的导出等。总体来说pyvista是一款渲染效果很棒的可视化软件，但是性能相对来说没有那么可观，对于规模不大的体系还是一个非常好用的工具，推荐使用。 阅读全文

摘要：可视化可以说在所有的研究领域中都是要仔细斟酌的问题，一个好的可视化工具不仅可以为工作的开展带来极大的便捷，在一些特殊的场景下还可以辅助人们进行一些重要的决策。比如在物理学领域中，最开始寻找相变点的技巧其实也是依赖于实验数据的可视化来实现的。而在深度学习领域，可视化模型、可视化训练过程、可视化参数以及可视化的总结，可以让我们迅速的得到模型好坏的结论，这一点我们在本文中通过研究MindInsight的一些安装与使用技巧来进行实现。 阅读全文

摘要：本文作为一个入门级的文章，主要介绍了分子动力学模拟中增强采样的基本概念与相应工具的安装和使用。PLUMED是业界比较出名的一款增强采样开源软件，能够对接多个分子动力学模拟软件，如GROMACS等，并利用这些软件生成的路径信息来进行采样。并且为了可以在python上也能看到路径信息等重要数据，可以考虑使用mdconvert将路径数据转化成python上常用的hdf5格式并用h5py进行读写。 阅读全文