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橙子牛奶糖
简介:陈文燕,本科暨南大学,中科院博士。 欢迎关注微信公众号“bio生物信息”,进群与众多生信同行一起讨论学术问题。私信不回,有问题请在文章下面评论。
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2018年1月10日
四种不同的SNP calling算法call低碱基覆盖度测序数据时,SNVs数量的比较(Comparing a few SNP calling algorithms using low-coverage sequencing data)
摘要: 摘要:如果不设置任何过滤标准的话,SOAPsnp会call出更多的SNVs;AtlasSNP2算法比较严格,因此call出来的SNVs数量是最少的,GATK 和 SAMtools call出来的数量位于SOAPsnp 和 Atlas-SNP2之间;四种calling算法的整体一致性是很低的,尤其在n
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posted @ 2018-01-10 15:36 橙子牛奶糖
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