摘要： 格式： for i in {1,2,3,4,5}do echo "${i}"done #首先设置所用程序的路径 samtools='samtools的路径' geneBody_coverage='geneBody_coverage.py的路径' bedFile='hg38_GENCODE_V42_C 阅读全文

摘要： 使用wget命令加下载链接进行下载 下载hg19注释文件: wget https://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human/release_41/GRCh37_mapping/gencode.v41lift37.annotation.gt 阅读全文

摘要： 本文将介绍在没有sudo权限的情况下如何从源代码编译和安装Python 首先，输入如下命令下载希望安装的版本的源代码，例如Python-3.12.1 wget https://www.python.org/ftp/python/3.12.1/Python-3.12.1.tgz 然后，输入如下命令解压 阅读全文

摘要： 最近部分工作需要在linux系统下操作，想着在自己本本上安装个虚拟机，废了九牛二虎之力安装好了VMware及Ubuntu系统，但是其在主机和虚拟机间共享数据不是很方便。于是又废了半天劲安装了VMware tools，设置了共享盘、并启动后自动挂载。一切搞定后，无意中发现windows下可以安装lin 阅读全文

摘要： 在shell脚本定义变量为 xx="xxx" 例如把一个路径或文件名定义为一个变量 inputPath="/mnt/RNASeq/Result" fileName="202308071824_210901003_2D230327074US2S2745DX" 在路径"/mnt/RNASeq/Resul 阅读全文

摘要： 在windows上通过ssh登录linux节点处理数据，使用MobaTextEditor编辑shell脚本后，在linux上运行总是报错找不到路径 报错 其根本原因是 windows下每一行的结尾符是\n\r，而linux下是\n，所以windows下编写的shell脚本拷贝到linux下时会多一个 阅读全文

摘要： data_frame = pd.read_csv(Filepath, encoding='utf8') 在使用上述代码读取csv文件时报错“UnicodeDecodeError: 'utf-8' codec can't decode byte 0xa1 in position 13: invalid 阅读全文

摘要： 从Notepad++可以直接配置快捷键运行当前python程序。 点击 运行(R) -运行(R)... 在弹出的输入框内输入以下命令，点击 保存... 分配一个名称与快捷键，即可以按快捷键运行当前程序。 cmd /k cd /d "$(CURRENT_DIRECTORY)" & python "$( 阅读全文

摘要： 在使用python时经常会遇到需要安装第三方库的情况，尤其是在一台新的服务器或者电脑上工作的时候。例如，在运行代码时出现下所示提示时，意思是本地没有pandas包，需要安装。此时可以在cmd终端窗口中使用pip进行安装。 Traceback (most recent call last): File 阅读全文

摘要： 在安装好python后，有时候会根据需要安装一些python包，默认的pip源地址下载速度往往比较慢，经常会报超时错误。比较好的解决办法是修改pip默认源为国内源。国内比较靠谱的源地址有： pypi 清华大学源：https://pypi.tuna.tsinghua.edu.cn/simple pyp 阅读全文