linux批量重命名

通过组合find 和exec 实现

find [查找路径] [匹配条件] -exec [执行命令] \; 或 {} +

这是 find 命令的经典用法：先按条件查找文件，再对找到的文件执行指定操作。

例如

find /path -name "*.fq.gz" -exec sh -c 'for f;do mv $f ${f%.fq.gz}_R1.fq.gz;done' _ {} +

以下详解来自AI
① find /path -name "*.fq.gz"

• find /path：从 /path 目录开始（包括所有子目录）递归查找文件。
• -name "*.fq.gz"：只匹配文件名以 .fq.gz 结尾的文件（* 是通配符，表示任意字符）。
  例如：会匹配 file1.fq.gz、subdir/file2.fq.gz 等。

② -exec sh -c '...' _ {} +

这是核心执行部分，用于对找到的文件进行重命名，可拆分为以下子部分：

❶ -exec

find 的参数，意思是 “对每个找到的文件执行后面的命令”。

❷ sh -c '...'

启动一个新的 Shell 进程，并执行单引号中的命令。
这里的 sh 是 Shell 解释器（如果系统中 sh 是 bash 或 dash 等，会影响语法支持，后面会提到）。

❸ 单引号中的命令：for f; do mv $f ${f%.fq.gz}_R1.fq.gz; done

这是实际处理文件的逻辑，是一个循环：

• for f; do ... done：遍历所有传递给 Shell 的文件参数（f 是循环变量，代表当前处理的文件路径）。
• mv $f ...：mv 是重命名 / 移动文件的命令，$f 是当前文件的原始路径（如 subdir/file.fq.gz）。
• ${f%.fq.gz}_R1.fq.gz：对文件名进行处理：
  • ${f%.fq.gz}：使用 Shell 的参数扩展，从 $f 的末尾删除最短的 .fq.gz 后缀（例如 file.fq.gz 会变成 file）。
  • 拼接 _R1.fq.gz 后，新文件名为 file_R1.fq.gz。

❹ _

这是传递给 sh -c '...' 的第一个参数（即 $0），用于表示 Shell 脚本的 “名称”（占位符，无实际作用，通常用 _ 或 sh 代替）。

❺ {} +

find 的占位符，表示 “将所有找到的文件路径一次性传递给前面的命令”（而 {} \; 是逐个传递）。
例如：如果找到 3 个文件，{} + 会把它们作为参数一次性传给 sh，效率更高。

 

命令执行步骤：

1. find 找到这两个文件，得到路径列表。
2. find 通过 {} + 将路径一次性传给 sh -c '...'，相当于执行：
   sh -c 'for f; do mv $f ${f%.fq.gz}_R1.fq.gz; done' _ /path/sub1/data1.fq.gz /path/sub2/data2.fq.gz
3. 循环处理每个文件：
   • 第一个文件：mv /path/sub1/data1.fq.gz /path/sub1/data1_R1.fq.gz
   • 第二个文件：mv /path/sub2/data2.fq.gz /path/sub2/data2_R1.fq.gz
4. 最终两个文件被重命名为带 _R1 后缀的版本。

可能的问题与优化

• Bad substitution 错误：如果系统的 sh 是 dash（不支持部分扩展语法），可能报错。此时可改用 bash -c 替代 sh -c。
• 文件名含特殊字符：如果文件名有空格、引号等，$f 可能被解析错误，建议用双引号包裹：mv -- "$f" "${f%.fq.gz}_R1.fq.gz"（-- 避免文件名以 - 开头被误判为选项）。

数据路径复杂时更健壮的脚本如下

find /path -name "*.fq.gz" -exec bash -c 'for f; do mv -- "$f" "${f%.fq.gz}_R1.fq.gz"; done' _ {} +

 或者也可以用//直接进行字符替换

find ./Results/ -name "*.fq.gz" -exec bash -c 'for f; do mv -- "$f" "${f/.fq.gz/_R1.fq.gz}"; done' _ {} +