PacBio长序列纠错软件之LoRDEC

首先，利用准确度高的二代数据（NGS数据）构建简洁的de Bruijn Graph（DBG）；然后，依次对每条PacBio长读长Reads进行纠错。

 

trim校正后的PacBio序列

      lordec-trim -i CorrectHQ.fa -o lordec_trimmed_reads.fa

trim和分割校正后的PacBio序列

      lordec-trim -i CorrectHQ.fa -o lordec_trimmed_reads.fa

参考来源：

https://www.jianshu.com/p/7e66ba539ddf

posted on 2019-09-06 16:34  BPSO_mynotes  阅读(565)  评论(0)    收藏  举报

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