2025年12月20日

转录组分析（七）：数据准备——参考基因组、基因注释、gtf格式转换（gffread）

摘要： 三、下载参考基因组 常用参考基因组数据库： Ensembl（人、动物）：https://ftp.ensembl.org/pub/ EnsemblGenomes（植物、细菌、真菌、其他）：https://ftp.ensemblgenomes.org/pub/ NCBI：https://ftp.ncbi 阅读全文

posted @ 2025-12-20 20:10 asaca_r 阅读(48) 评论(0) 推荐(0)

转录组分析（六）：数据准备——样本信息表

摘要： 二、准备样本信息表 将测序文件重命名为更易理解的编号 1. excel上完成 （1）将run selector表格复制到excel，保留有用的列 （2）使用CONCAT合并字符串 2. linux命令生成 （1）样本名生成 # bash shell脚本 # 两组，每组4个时期，3个重复 for pr 阅读全文

posted @ 2025-12-20 19:57 asaca_r 阅读(5) 评论(0) 推荐(0)

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