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摘要: 一、K-means 非监督学习中有一大类问题是聚类问题,其中有个经典算法:K-means,其中K代表我们事先已经知道要将数据集分成K类 。K-Means算法的思想很简单,对于给定的样本集,按照样本之间的距离大小,将样本集划分为K个簇。让簇内的点尽量紧密的连在一起,而让簇间的距离尽量的大。 原理如下图 阅读全文
posted @ 2018-06-28 15:29 河水青山1 阅读(173) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、pd.cut()与pd.qcut()的区别 假设有一组人员数据,而你希望将它们划分为不同的年龄组 ages = [18,20,22,25,27,21,23,37,31,61,45,32] bins = [18,25,35,60,100] cats = pd.cut(ages, bins)#将ag 阅读全文
posted @ 2018-06-21 14:48 河水青山1 阅读(343) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、正确安装sklearn却提示No module named 'sklearn.lda' It seems that you have installed a newer version of sklearn but you are trying to call an old one 阅读全文
posted @ 2018-06-13 09:58 河水青山1 阅读(101) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Chapter 3:A Tour of Machine Learning Classifiers Using Scikit-learn 3.1:Training a perceptron via scikit-learn 3.2 Training a logistic regression mode 阅读全文
posted @ 2018-06-05 13:48 河水青山1 阅读(211) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、基本思想:“模型已定,参数未知” 假如有一个罐子,里面有黑白两种颜色的球,数目多少不知,两种颜色的比例也不知。 我们想知道罐中白球和黑球的比例,但我们不能把罐中的球全部拿出来数。 现在我们可以每次任意从已经摇匀的罐中拿一个球出来,记录球的颜色,然后再放回罐中。 这个过程可以重复,我们可以用记录的 阅读全文
posted @ 2018-06-03 22:12 河水青山1 阅读(1470) 评论(0) 推荐(0)
摘要: python安装要注意第三条 python下载 一、xgboost windows下:pip install xgboost下出现下面的错误-No files/directories.尝试下载xgboost.whl文件,然后再该whl文件的所在目录下执行pip install xgboost‑0.7 阅读全文
posted @ 2018-05-28 10:13 河水青山1 阅读(565) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、Indel Pindel:跟其他Call Indel的软件不大一样,Pindel用的是一个叫pattern growth的算法来检测Indel以及其他的结构变异(所以才叫P-Indel的吧),具体算法:http://gmt.genome.wustl.edu/packages/pindel/,引用 阅读全文
posted @ 2018-05-23 14:42 河水青山1 阅读(597) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、定义 数学中,如果一个函数足够平滑的话,已知函数在某一点的各阶导数值的情况之下,泰勒公式可以用这些导数值做系数构建一个多项式来近似函数在这一点的邻域中的值。泰勒公式还给出了这个多项式和实际的函数值之间的偏差。 泰勒公式是将一个在x=x0处具有n阶导数的函数f(x)利用关于(x-x0)的n次多项式 阅读全文
posted @ 2018-05-17 22:29 河水青山1 阅读(2670) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、所需软件 Java 必须安装。Hadoop 2.7 及以后版本,需要安装 Java 7 ssh 必须安装并且保证 sshd 一直运行,以便用 Hadoop 脚本管理远端Hadoop 守护进程,如果没有安装,ubuntu系统: $ sudo apt-get install ssh $ sudo a 阅读全文
posted @ 2018-05-14 21:08 河水青山1 阅读(385) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 一、基因芯片原理简介 基因芯片(gene chip)测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法 如上图:在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧 阅读全文
posted @ 2018-04-28 14:20 河水青山1 阅读(1385) 评论(0) 推荐(0)
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