随笔分类 -  Python

基于形状的三维医学图像插值(二)
摘要：上篇存在的问题 这周和小组同学一起讨论，分析存在问题主要是由于以下两个原因 间隔1度取一个方向，再在这个方向上做插值，这个1度的间隔本身就漏掉一些点，并且会存在在边界处，越来越宽的情况 沿着当前方向计算时取出的点的坐标是浮点数，直接四舍侮五入造成的误差 解决方案 根据以上问题，**首先解决需要解决的 阅读全文
posted @ 2021-06-26 22:05 简约的信仰 阅读(514) 评论(0) 推荐(0)
求同一个病例在拍摄的MRI和CT上的公共区域
摘要：需求 项目中需要求同一个患者在不同时间和不同设备下获取的MRI和CT的公共区域，由于目前项目中使用的配准代码（将MRI配准到CT上）不是开源的，所以只能考虑在配准前找到公共区域后，将MRI和CT的序列截断后重新保存成mhd文件，再看看配准效果是否有提升。 已知：（1）根据训练好的模型可以预测出CT序 阅读全文
posted @ 2021-05-06 00:33 简约的信仰 阅读(181) 评论(0) 推荐(0)
脑部CT中线截断
摘要：任务描述 与之前脑部MRI中线截断类似，处理根据每一层图像手工标注的点拟合的直线，截断超出脑部以外的线段，提供给模型训练 示例 如上图中，红色是根据手工标注的点拟合出来的直线（mask），框出的直线就是需要截断的，由于MRI是没有颅骨的，为了后期可能需要根据这个中心点求CT与MRI的公共区域 所以前 阅读全文
posted @ 2021-03-25 15:50 简约的信仰 阅读(571) 评论(2) 推荐(0)
使用传统方法（python）截断脑部MRI图像（二维）中线
摘要：使用传统方法（python）截断脑部MRI图像（二维）中线 任务描述 **前提：**根据对脑部MRI图像的每一层的中线手工标注的点，拟合出的中线，如下图： 中间层以上 中间层以下 **需求：**截断拟合出来的中线超出脑部区域的部分，如下图中绿色框中的线段，（只留下高量区域的上端点和下端点连接的线段— 阅读全文
posted @ 2021-03-11 15:49 简约的信仰 阅读(1114) 评论(0) 推荐(0)
本地PyCharm 远程连接服务器，更改了服务器上python解释器，PyCharm上解释器不同步
摘要：问题描述 考虑到节省空间，实验室设置了常用的环境，我自己之前设置的环境版本已经有一个共有的，所以将自己的环境删掉了，相应地根据以下步骤设置PyCharm上的解释器之后应用，运行时还是显示原先自己设置的虚拟环境解释器 根据服务器上虚拟环境的解释器的路径设置 运行时还是我自己设置的虚拟环境的解释器，因为 阅读全文
posted @ 2021-02-25 14:31 简约的信仰 阅读(738) 评论(0) 推荐(0)
本地PyCharm 远程连接服务器调试程序，代码未自动上传
摘要：问题描述 根据教程设置本地PyCharm远程连接服务器后，根据以下的设置了自动上传，在本地修改代码后，服务器端还是没有实时更新代码 解决步骤 在设置远程解释器的时候加上映射路径 先设置了ssh远程连接，这里选择第二个选项 interpreter设置成你的服务器上的虚拟环境的python的解释器对应路 阅读全文
posted @ 2021-02-25 13:53 简约的信仰 阅读(2108) 评论(0) 推荐(0)
Pycharm中matplotlib图形不显示
摘要：​ 参考博客： https://blog.csdn.net/weixin_38410551/article/details/92794611?utm_medium=distribute.pc_relevant.none-task-blog-BlogCommendFromMachineLearnPai 阅读全文
posted @ 2020-10-10 20:54 简约的信仰 阅读(1409) 评论(0) 推荐(0)
Anaconda中打开自带的jupyter出现连接不上python服务的问题
摘要：Anaconda中打开自带的jupyter出现连接不上python服务的问题 问题描述： 在Anaconda中选择自己创建的环境，打开jupyter，打印语句无法输出，关键字颜色没变，运行出现In[*] 观察左边红色框中的🔗符号，这说明当前环境没有连接上python的服务，使用快捷键shift+e 阅读全文
posted @ 2020-10-10 18:48 简约的信仰 阅读(3899) 评论(0) 推荐(0)