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ggpubr之GO结果可视化
摘要:本文首发微信公众号: "青年卓越" GO分析 在生物学领域,我们常会拿到很多基因的名字,而这些基因具体在机体具体有哪些生物学功能,这就需要我们对这些基因进行功能注释,目前在对基因集注释分析过程中,最常用的分析方法就是GO分析,该分析可在DAVID,当然这个数据还有很多其它的功能,如基因ID转换,在数 阅读全文
posted @ 2019-12-04 17:51 kenmly墨雲 阅读(771) 评论(0) 推荐(0)
ggpubr和ggplot2绘制箱线图
摘要:更多消息,请关注微信公众号: "青年卓越" 阅读全文
posted @ 2019-12-01 19:02 kenmly墨雲 阅读(723) 评论(0) 推荐(0)
R包安装报错及正确安装方式
摘要:安装R包常见报错 新手在安装R包的过程中,经常性的会遇到一些问题,我认为常见的有以下几种: 中文用户名导致的报错 如:Fatal error: ERROR system error 5;所以在学R之前建议将电脑用户名改为英文的,以后的学习中各种文件命名也尽量使用英文,毕竟人家老外开发的软件。该报错的 阅读全文
posted @ 2019-11-27 09:54 kenmly墨雲 阅读(1129) 评论(0) 推荐(0)
RNA-seq表达数据之样本PCA分析
摘要:Principal component analysis (PCA) 分析 主成分分析(PCA)帮助我们归纳总结和可视化数据集中的信息,这些数据包含由多个相互关联的变量描述的个体 / 观察主成分分析。 可以将每个变量视为不同的维度。 但如果您的数据集中有3个以上的变量,那么很难在多维超空间可视化。 阅读全文
posted @ 2019-11-26 19:24 kenmly墨雲 阅读(14132) 评论(0) 推荐(1)
转录组研究中上下调DEGs的输出
摘要:转录组研究中上下调DEGs的输出 随着高通量测序技术的发展,组学研究如雨后春笋,而转录组更是应用最多,最常规的基因表达差异研究的手段,转录组(transcriptome)广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的集合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的集 阅读全文
posted @ 2019-11-26 19:14 kenmly墨雲 阅读(1710) 评论(1) 推荐(0)