摘要：
在单细胞测序数据分析中，barcodes、features和matrix是三个最核心的基础文件，它们共同构成了所有分析的基石。 特性维度 细胞条形码 (barcodes，BC) 表达矩阵 (Matrix) 核心角色 细胞身份证 核心数据账本 功能定位 定位数据属于哪个细胞 分析每个细 阅读全文
posted @ 2026-01-21 12:51
Singer檸
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摘要：
常见指标 是什么？ nFeature_RNA 一个细胞表达了多少种不同的基因 nCount_RNA 一个细胞里检测到的所有RNA分子（UMI）总数 percent.mt 细胞中线粒体基因的RNA占比 percent.HB 细胞中血红蛋白基因的RNA占比 nFeature_RNA（左上图） 判断细胞质 阅读全文
posted @ 2026-01-21 12:09
Singer檸
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摘要：
Seurat对象：存储数据，将原始数据、分析过程、中间结果和最终结论有机地整合在一起，确保了分析流程的标准化、可追溯和可重复。 其核心结构是一个名为 AnnotatedChip 的S4类对象，它包含多个称为 域（slots） 的组成部分。我们可以将这些域分为四大功能模块来理解： 模块一：数据核心 阅读全文
posted @ 2026-01-21 11:38
Singer檸
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