摘要: 这种图 数目 分数 标签的图 我想问 它这里标签会重合 那是想反映识别上的问题? 这种图叫做直方图,通常用来展示数据的分布情况。图中不同颜色的区域代表不同的标签(如negative、positive、critical),它们在横轴上的分布显示了每个标签在不同预测分数区间的数量。 标签重合的现象可能反 阅读全文
posted @ 2025-10-21 13:07 GraphL 阅读(11) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 四种loss 让我仔细分析一下 criterion_sv.py 中的损失函数结构,来回答你的问题。 [5 tools called] 现在我明白了!让我回答你的问题: 关于 criterion_sv.py 中的损失函数结构 根据代码分析,这里实际上有4种不同的损失函数,而不是3种: 1. GT Lo 阅读全文
posted @ 2025-06-26 16:00 GraphL 阅读(66) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 蛋白质和细胞之间不是包含关系,而是蛋白质是细胞的重要组成成分和功能执行者。 蛋白质是细胞的组成成分 细胞由各种各样的分子构成,其中蛋白质占比很高。例如细胞膜主要是由磷脂双分子层和镶嵌其中的蛋白质组成。这些膜蛋白可以起到运输物质、接收信号等多种作用。像细胞膜上的葡萄糖转运蛋白(GLUT),它可以将葡萄 阅读全文
posted @ 2025-06-19 19:31 GraphL 阅读(84) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Sure, here’s a concise definition and formulation of online reinforcement learning (online RL), with context using \(D\) as the current data batch or 阅读全文
posted @ 2025-06-17 21:34 GraphL 阅读(35) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Great question. Let’s clarify the logic behind multi-GPU (multi-card) training (single server) and multi-server distributed training, as well as how d 阅读全文
posted @ 2025-06-10 14:13 GraphL 阅读(43) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Certainly! Here’s a concise table showing for each model whether it takes a sequence as input and whether it is primarily used to generate text (natur 阅读全文
posted @ 2025-06-09 19:12 GraphL 阅读(35) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 文本的增强 在 融合步骤 中,序列中的每个残基嵌入([L, D])与多属性文本描述产生的单一文本嵌入([1, D]) 结合 或 关注。 机制: 序列嵌入 :X_seq 形状为 [L, D](例如,每个残基 1280 维,共 L 个残基)。 文本嵌入 :X_text 形状为 [1, D](例如,768 阅读全文
posted @ 2025-06-04 15:22 GraphL 阅读(14) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 好的,以下是翻译成中文的内容: 以下是关于生物化学和分子生物学中蛋白质/肽类抗体、配体/小分子和酶之间区别的清晰分解: 1. 蛋白质/肽类抗体 定义 :抗体是由免疫系统中的 B 细胞产生的大型 Y 形蛋白质(免疫球蛋白)。它们能够特异性识别并结合外来分子(抗原),例如病毒、细菌或毒素。 类型 :始终 阅读全文
posted @ 2025-06-04 14:38 GraphL 阅读(182) 评论(0) 推荐(0)
摘要: Mamba 中的 SSM(状态空间模型)不是传统意义上的计算 attention 的方式,但它与 attention 机制有密切联系和相似性,相关内容如下: 与 attention 机制的联系 公式相似性 :有研究指出 Mamba 的 SSM 操作与线性 attention 存在深刻联系,从公式和示 阅读全文
posted @ 2025-05-27 15:13 GraphL 阅读(180) 评论(0) 推荐(0)
摘要: 任务 以下是 PocketGen 论文描述的总结翻译: 🔹 输入 配体分子: 以三维结构(坐标和原子类型)提供。 蛋白质支架: 除去口袋区域的蛋白质的其余部分。 同样表示为三维点云。 🔹 模型架构 1. 等变双层图变换器 目标:对完整原子结构进行编码和更新。 结构: 建模 残基/配体级别 和 原 阅读全文
posted @ 2025-05-23 13:41 GraphL 阅读(50) 评论(0) 推荐(0)