不加酵母的面团

摘要：

俺是一枚小小的生信狗！俺是生信大军内的一位小步兵！俺想用自己的小小笔记，记录自己的生长，也给同样需要的人一些帮助！当然也有一点点小小顾虑！为啥子在AI盛行的年代，还要手搓一个博客呢？要做什么，丢给AI就好啦，一条龙服务。就我自己的经验来说，我算是在AI风靡中国，几乎人手一个AI之前我就接触了阅读全文

posted @ 2026-06-01 22:33 不加酵母的面团阅读(17) 评论(0) 推荐(0)

2026年8月25日

Darpas1/2分析APA

摘要： Darpars 1/2 介绍 dapars家族主要原理是依据：利用标准 RNA-seq 在 3′UTR 上的覆盖度变化，来推断可变多聚腺苷酸化（APA）事件。目前，有两个版本。两个版本各有各的特点。对于Dapars1：可以进行处理组和对照组的差异APA的分析对于Dapars2：可以进行多线程阅读全文

posted @ 2026-08-25 17:14 不加酵母的面团阅读(3) 评论(0) 推荐(0)

使用PAPA检测和定量新发现的最后一个外显子/多聚腺苷酸化事件

摘要：

0.0-introduction PAPA：用于从批量RNA测序数据中检测和定量新型末端外显子/多聚腺苷化事件的Snakemake流程这是在github内对于该工具的介绍。 2020年该方法开发并发布在预印版内。https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020 阅读全文

posted @ 2026-08-25 11:09 不加酵母的面团阅读(2) 评论(0) 推荐(0)

2026年8月19日

2-MAGeCK下游质控和可视化结果

摘要：下游基本分析 1.文库质控文库质控主要是看MAGeCK count模块下输出的文件*.countsummary.txt内的指标我们主要关注的是Percentage和GiniIndex这两指标。 Percentage：代表的是所有测到的reads内可以和文库内的序列比对上的比例。可以认为是建库的有阅读全文

posted @ 2026-08-19 15:39 不加酵母的面团阅读(2) 评论(0) 推荐(0)

2026年6月25日

1-使用MAGeCK分析pooled CRISPR screening数据

摘要： https://pic1.imgdb.cn/item/6a3dd492bb21102f81d7f136.png 阅读全文

posted @ 2026-06-25 19:17 不加酵母的面团阅读(39) 评论(0) 推荐(0)

2026年6月23日

0-什么是CRISPR screening？

摘要：这篇文献https://www.nature.com/articles/s43586-021-00093-4很好地阐述了目前的筛选模式，分析软件和应用前景。非常值得一看。 CRISPR screening概念我们可以通过提前对基因设计多个靶向它的sgRNA的文库，将这个文库以低MOI的浓度感染进细阅读全文

posted @ 2026-06-23 21:08 不加酵母的面团阅读(19) 评论(0) 推荐(0)

如何下载和汇总疾病相关变异位点数据

摘要： https://blog.csdn.net/weixin_49320263/article/details/131196600 可以先看看这篇推文内关于下载数据的介绍 FinnGene 进入https://finngen.gitbook.io/documentation/data-download 阅读全文

posted @ 2026-06-23 16:50 不加酵母的面团阅读(56) 评论(0) 推荐(0)