随笔分类 -  单细胞转录组实战

摘要：许多大佬的软件想要构建一个大而美的生态，从 monocle2 开始就能做单细胞的质控、降维、分群、注释这一系列的分析，但不幸的是我们只知道 monocle 系列还是主要做拟时序分析，一方面是因为 Seurat 有先发优势，出名要趁早，生态太过强大，另一方面 monocle2 和monocle3 软件 阅读全文

摘要：在单细胞RNA测序分析中，可视化是揭示数据背后生物学模式的关键步骤。Seurat作为单细胞分析的主流工具，虽然功能强大，但在可视化方面仍有提升空间。今天就为大家介绍Seurat的增强包——SeuratExtend，它能让你的单细胞图表瞬间提升一个档次！ 单细胞转录组、空间转录组、转录组（mRNA-s 阅读全文

摘要：在单细胞转录组研究中，参考基因组的质量直接决定了基因定量的准确性。对于研究 Epstein-Barr 病毒（EBV）相关疾病（如 Burkitt 淋巴瘤、鼻咽癌等）的科研人员来说，仅使用人类参考基因组往往无法捕捉病毒基因的表达信息。今天，我们就来详细介绍如何构建包含人类基因组与 EBV 基因组的融合 阅读全文