随笔分类 - bioinfo
生物信息学,多组学数据分析以及系统生物学笔记
摘要:注:PCA是最常用的一种降维方法,降维后得到的每一个主成分是各个特征的线性组合。PCA也被称为“没有截距的回归模型”[1],因为其简单和直观,应用非常广泛。 本文相关的代码和数据:https://github.com/OnlyBelter/jupyter-note/blob/master/machi
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摘要:注:这几个名词是RNA-Seq数据分析中的基础,在此小结一下。 在RNA-Seq的分析中,对基因或转录本的read counts数目进行标准化(normalization)是一个极其重要的步骤,因为落在一个基因区域內的read counts数目取决于基因长度和测序深度。很容易理解:一个基因越长、测序
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摘要:注:从进入生信领域到现在,已经过去快8年了。生物信息学包含了我最喜欢的三门学科:生物学、计算机科学和数学。但是如果突然问起,什么是生物信息学,我还是无法给出一个让自己满意的答案。于是便有了这篇博客。 起源 据说在1970年,荷兰科学家Paulien Hogeweg和Ben Hesper最早在荷兰语中
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