摘要：ThelogCPM values can optionally be converted to RPKM or FPKM by subtracting log2 of genelength, see rpkm(). The Arabidopsis case study of Section 4.6 ... 阅读全文

摘要：此次只用了order 错误，应该用rank> nlxl1 nlxl2 nlxl3 nlxl4 nlxl5 nlxl6 x sort(x)[1]32677485939799 100> order(x)[1] 5 8 4 3 2 1 7 6> rank(x)[1] 6 5 4 3 1 8 7 2假设x为... 阅读全文

摘要：R语言的逻辑操作包括以下几项：http://blog.sina.com.cn/s/blog_403aa80a0101cz2s.html!取非如：> x !x输出结果为： FALSE如：> x !x输出结果为：F,F,T,F,T&和 &&这两者都是逻辑与，操作都是x&y和x&&y如：> x y ... 阅读全文

摘要：滤除小于RPKM小于10的基因> frame210)&(lxl2>10)&(lxl3>10)&(lxl4>10)&(lxl5>10)&(lxl6>10),select = list:lxl6)以下为引用：http://blog.sina.com.cn/s/blog_62b37bfe0101f4h0.... 阅读全文

摘要：edgeR的使用发表于2013 年 12 月 15 日1. edgeR简介与安装edgeR，Empirical analsis of digital gene expression data in R. Differential expression analysis of RNA-seq and ... 阅读全文

摘要：安装的R版本为R.3.0.0;安装BioConductor：> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")> biocLite()安装edgeR：> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")> biocLi... 阅读全文

摘要：问题:直接使用CRAN的源出现如下错误Warning in install.packages :InternetOpenUrl failed: '无法解析服务器的名称或地址'Warning in install.packages :unable to access index for reposit... 阅读全文