2019年7月5日

cgdsR 下载TCGA数据
摘要： TCGA 的数据可以在5个组织机构获取，它们都提供了类似的接口来供用户下载数据。 cgdsR 包是cBioPortal 提供的R包 http://www.cbioportal.org/rmatlab cgds -- Cancer genomic Data Service 安装 cgdsR 使用 cg 阅读全文
posted @ 2019-07-05 17:20 0820LL 阅读(604) 评论(0) 推荐(0)
GSEA 基因集富集分析
摘要： http://software.broadinstitute.org/gsea/index.jsp GSEA（Gene Set Enrichment Analysis）是一种生物信息学的计算方法，用于确定是否存在这样一个基因集，能在两个生物学状态中显示出显著的一致性的差异。表达谱数据里的基因数目众多 阅读全文
posted @ 2019-07-05 15:49 0820LL 阅读(2491) 评论(0) 推荐(0)
lastal
摘要： http://last.cbrc.jp/doc/lastal.html This program finds local alignments between query sequences, and reference sequences that have been prepared using 阅读全文
posted @ 2019-07-05 10:25 0820LL 阅读(489) 评论(0) 推荐(0)

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