2018年9月30日

摘要: 问题背景 系统:ubuntu,当输入exit退出shell时,出现There are stopped jobs 无法退出shell 解决办法 找到这个stopped job然后终止它 阅读全文
posted @ 2018-09-30 14:30 0820LL 阅读(413) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: 获取字符串长度: ${#字符串变量名} 截取子串: 1. expr substr 字符串 起始位置 截取长度 2. 命令输出 | cut -c 起始位置-结束位置 命令输出 | cut -c "分隔符" -f 字段编号 3. 使用 ${ } 表达式 ${字符串:起始位置:截取长度} ${字符串::截 阅读全文
posted @ 2018-09-30 11:22 0820LL 阅读(400) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: awk退出函数 exit awk中使用shell变量 awk 'BEGIN{FS="\t"; OFS="\t"}{if($2 == "'$accession'"){print($2, $3); exit 0}}' nucl.accession2taxid.txt 遍历 fastq_pass 目录中的 阅读全文
posted @ 2018-09-30 11:21 0820LL 阅读(158) 评论(0) 推荐(0) 编辑
摘要: sed的基本命令 替换 s sed 's/原字符串/替换字符串/' # 只替换每行的第一个 sed 's/原字符串/替换字符串/g' # 替换所有匹配关键字sed -i '43,$s/^/chr/' af-only-gnomad.raw.sites.b37.vcf # 直接操作源文件,从43行开始至 阅读全文
posted @ 2018-09-30 11:20 0820LL 阅读(85) 评论(0) 推荐(0) 编辑

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