药物靶点筛选
药物靶点：
药物靶点是指药物在体内的作用结合位点，包括基因位点、受体、酶、离子通道、核酸等生物大分子。
如果是酶，应该可以由分子对接提供一定的线索，然后去找相关的抑制剂啥的进行测定。
如果是受体，我觉得可以考虑做下蛋白组学研究，看下药物作用后，哪些蛋白质有上调或者下调，通过这些蛋白质进行信号通路的检索，找到药物作用的信号通路中的点。
这是一项工程浩大的工作啊。
参考：https://www.zhihu.com/question/42072596
如何根据药物的结构信息寻找药物的靶标？参考：https://www.zhihu.com/question/42072596
化学药，从药物结构看，一般可以看过去的药物的靶点，因为这类药物结构具有相似性，结构简单。
生物药，蛋白类和抗体类药物，单从结构上很难推断，因为目前研究技术对于蛋白修饰还存在很大挑战，完整解析蛋白上所有的修饰还有一段路要走。
可能的方法有：信号通路的方法（但同一种机制，可能存在多种信号通路）；蛋白质谱（非常好的研究修饰的工具，目前有关于糖基化和磷酸化的质谱）。
但是，想从结构信息去找可能靶点，首先还是得从技术层面解决所有结构信息问题。
发现药物靶点的实例：
http://blog.sciencenet.cn/blog-3384137-1118746.html 应用化学定量蛋白质组学方法发现天然产物(黄芩苷)的作用靶点
研究中药药理发SCI文章：
中药发文章的套路：
http://paper.dxy.cn/article/41069 2012，丁香园 中药论文也可以发表在 SCI 杂志
网络药理学：https://zhuanlan.zhihu.com/p/69988192
网络药理学（network pharmacology）认为药物是作用于多个靶点，并通过多靶点间的相互作用产生增效减毒的效果。网络药理学从相互联系的角度研究问题。
通过构建药物-靶点-疾病之间的复杂网络分析药物的作用机制，使药理研究由传统寻找单一靶点转向综合网络分析。
研究套路、实例：
https://zhuanlan.zhihu.com/p/97102410 中药复方网络药理学文章套路
https://www.biowolf.cn/m/view.php?aid=240 基于网络药理学的研究思路和方法 基于网络药理学的茵陈五苓散作用机制分析
https://www.biomart.cn/news/16/2812471.htm 解析：用黄连解毒汤治疗白血病的机制，2000年发于blood。
药物基因组学（pharmacogenomics）：
研究DNA和RNA特征的变异与药物反应相关性的科学，即研究基因序列的多态性与药物效应多样性之间的关系。
https://zhidao.baidu.com/question/1929680403253342987.html 值得读 搜索：药物基因组学 中药靶点
药物靶点的研究可在基因和蛋白质两个层面进行。”在中国科协第23期“新观点新学说”学术沙龙上，专家们的发言围绕着靶点这个术语展开。
并不是每一种药都找到了其药物靶点。......很多药物到目前并没有发现相应的靶点，但却是很好的药。比如现在治疗糖尿病的药物，很多都是先发现作用，再找到靶点
是药物就一定有靶点。“这个靶点没有找到并不代表没有靶点，如果将靶点的外延扩大就可以找到靶点。”......“很多药找不到靶点，可能是由于它们是在无机盐等小分子上起作用的。”他从自己的研究中推测，小分子也可能是一类被忽视的靶点，不应将搜索靶点的范围局限在生物大分子上
在寻找中药靶点的研究中进展困难，甚至连最常见的板蓝根，其靶点至今也没有明确。暨南大学药学院院长王玉强教授表示，现在很多中药是多成分、多靶点。现在，有些人认为这是一个“姑息”的说法，因为我们没有找到它有效的成分和靶点。
组合靶标其实就是多靶点。她指出，针对老年痴呆、心脑血管病等一些成因复杂疾病，单一靶点的药物难以见效。因此，可建立多靶标的体系，让多个“药靶”构成“靶场”。这些“靶场”组合起来形成一个谱，再用来筛选药物。
中药数据库：
TCMSP数据库
文献搜索：
1. pubmed搜索：new drug target sequencing expression target 药物基因组学
文献：Informatics and Computational Methods in Natural Product Drug Discovery: A Review and Perspectives，Front Genet. 2019
bioinformatics techniques can be used to discover how candidate drugs cause therapeutic activity within the human body, which can include predicting interactions between drugs and proteins, analysis of impact on biological pathways and functions, and elucidating genomic variants that can alter drug response
生信技术可用来发现：候选药物如何在人体内发挥作用，包括：药物与蛋白的互做、通路和功能的影响、基因变异影响药物在机体内的反应。
此图的含义：
生物信息学：gene expression；模拟蛋白质的三维结构和功能；种系遗传的方法（天然产物来自生物体，它要么是一个重要过程的一部分，要么有一个特殊的目的。所以，可以用进化的方法来研究。相似的物种产生相同的NP。）
知识库：从现存的各种库和数据中，挖掘药物。
文献：Highly selective inhibition of IMPDH2 provides the basis of antineuroinflammation therapy，2018，PNAS，北大屠鹏飞，中药研究的文章
文章解析：http://news.bioon.com/article/6706340.html
中药活性分子改造成为化学探针，利用反向药物寻靶策略从细胞中“钩钓”相应的药物靶点，进而针对所发现的靶点开展深入的生物学功能和分子药理机制研究，从靶点源头上诠释中药活性成分的治病机理。团队的研究在今年取得突破，发现中药苏木的关键活性成分苏木酮A发挥抗神经炎症的作用靶点为IMPDH2，即苏木酮A可通过直接作用于神经小胶质细胞中靶点蛋白IMPDH2的140位半胱氨酸位点，诱导其发生变构失活，进而抑制下游NF-κB等炎症相关信号通路，发挥抗神经炎症作用。该研究的意义在于阐明了苏木抗神经炎症的直接靶点，进而从细胞分子层面解释了其抗炎作用的分子机理；同时也为进一步指导临床精准用药和中药国际化推广奠定了理论基础。
深入阐明了中药活性成分苏木酮A（sappanone A）发挥抗神经炎症作用的分子靶点及其作用机制。
2. pubmed搜索：network pharmacology traditional chinese medicine target hit 搜索得到12篇 网络药理学
文献：Pharmacological Targets and the Biological Mechanisms of Formononetin for Alzheimer's Disease: A Network Analysis，2019，Med Sci Monit（IF=2）
花黄素在AD中的药物靶点和机制。纯生信分析：KEGG、GO、cytoscape。
文献：Exploring Pharmacological Mechanisms of Xueshuan-Xinmai-Ning Tablets Acting on Coronary Heart Disease Based on Drug Target-Disease Gene Interaction Network，2019，Phytomedicine（IF=4）
在冠心病中，研究Xueshuan-Xinmai-Ning的药物机制。利用drug，disease，gene的网络。
文献：In Silico Study of Anti-Insomnia Mechanism for Suanzaoren Prescription，2019，Front Pharmaco（IF=3）
酸枣仁汤治疗失眠，
