孟灵己  

2022年7月30日

摘要: 现在想尝试一下,如果我们将人特异性的序列分开来看,是否可以得到一些不太一样的信息? 现在先用SVA_D做一个测试。 1。提取SVA_D的人特异性的序列。 grep 'SVA_D' /home/xxzhang/workplace/project/geneRegion/repeat_interest.b 阅读全文
posted @ 2022-07-30 23:26 孟灵己 阅读(41) 评论(0) 推荐(0)
 
摘要: ssh xxzhang@192.168.79.84 cd /home/xxzhang/data/Epigenome/Roadmap/ 1、拆分原始bed文件,并重命名文件名 (base) [xxzhang@cu08 Roadmap]$ python /home/xxzhang/workplace/s 阅读全文
posted @ 2022-07-30 16:51 孟灵己 阅读(244) 评论(0) 推荐(0)
 
摘要: 首先,所有的以及人特异性的序列的转录因子的结果都已经出来了,这次想要按照重复家族,来试图解释: (1)我们已经有人表达特异性的基因和转录因子的数据集(师姐之前给过我) (2)不同的重复序列家族,结合的转录因子是否相同(从整体上看,也许也有一些文献的证据) (3)有否存在特异性的和插入序列家族结合的转 阅读全文
posted @ 2022-07-30 12:59 孟灵己 阅读(163) 评论(0) 推荐(0)